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xufund至尊木虫 (知名作家)
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[求助]
晶体复合物1xpb中的RNA和DNA怎么除去
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| 要做分子对接，但复合物结构中含有DNA，RNA不知如何除去，特请教大家。谢谢 |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-12-20 08:21:33
xufund: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢指点。不过我试了一下，它显示的大约有0-10个目录，打开后都是三个字母表示的东西，也搞不清楚哪个是RNA，哪个是DNA片段。能否再详细点拨一下？ 2012-12-20 21:26:11
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-12-20 08:21:33
xufund: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢指点。不过我试了一下，它显示的大约有0-10个目录，打开后都是三个字母表示的东西，也搞不清楚哪个是RNA，哪个是DNA片段。能否再详细点拨一下？ 2012-12-20 21:26:11
| 如果是mgltools的话，在左边的分子信息栏里面，如果你展开这个分子的话，所有的氨基酸序列，溶剂，配体信息都会显示出来。把你的DNA，RNA对应的片段选中，然后在edit里面选中delete selected atoms就好了。 |
2楼2012-12-19 20:37:21
lrf1980
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【答案】应助回帖
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chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-03-26 09:46:20
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-03-26 09:46:20
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http://www.pdb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1xbp 你应该仔细看看pdb上每个链的介绍，结构里看，没有人可以看得出来。另外如果你不知道哪个是的话，你应该多查查文献，这个软件只是帮你看结构的。 |
5楼2012-12-22 10:12:07
autodockytu 
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