应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求助关于转录组
51/1返回列表
查看: 1507  |  回复: 12
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

Alex_ppz

木虫 (小有名气)

[求助] 求助关于转录组

想问下大家，目前做的低等动物转录组测序，通过拼接得到了完整的转录组序列，但是这些序列有什么作用？想更深的研究应该再做些什么工作？谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
加油~~~
1楼2012-12-13 09:22:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by Alex_ppz at 2012-12-13 16:42:46
之前没有接触过转录组，来到新的实验室正好在做这个，老板让考虑下拿到这些片段之后的工作，这个转录组测序是正常组织的，没有刺激胁迫，大约拼出了有40000条片段。...

没有一个明确的目标就去测转录组，到最后很难去分析数据，并整理成文的。
另外，你转录组是多个组织分别测序的么？如果这样，也许还可以对不同组织之间进行比较，找点儿话题。如果就只有一个sample，悲剧了
赞一下 回复此楼
4楼2012-12-13 17:52:32
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
转录组测序只是个手段，科学研究应该先选定你感兴趣的现象/机理，再去思考方法论的问题；你这里貌似反过来了？
另外，如果对目的还不清楚，那我冒昧揣测 你的转录组对照组啥的也没有了？
另外问个体外话：低等水产动物的转录组，做了de novo拼接，怎么判断得到“完整的转录组”了？ 测序数据量有多大呢？
赞一下 回复此楼
2楼2012-12-13 10:43:43
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Alex_ppz

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-12-13 10:43:43
转录组测序只是个手段，科学研究应该先选定你感兴趣的现象/机理，再去思考方法论的问题；你这里貌似反过来了？
另外，如果对目的还不清楚，那我冒昧揣测 你的转录组对照组啥的也没有了？
另外问个体外话：低 ...

之前没有接触过转录组，来到新的实验室正好在做这个，老板让考虑下拿到这些片段之后的工作，这个转录组测序是正常组织的，没有刺激胁迫，大约拼出了有40000条片段。
赞一下 回复此楼
加油~~~
3楼2012-12-13 16:42:46
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Alex_ppz

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-12-13 17:52:32
没有一个明确的目标就去测转录组，到最后很难去分析数据，并整理成文的。
另外，你转录组是多个组织分别测序的么？如果这样，也许还可以对不同组织之间进行比较，找点儿话题。如果就只有一个sample，悲剧了...

确实只有一个sample，能否告诉下一般使用转录组设计实验的程序过程，举个例子，十分感谢！
赞一下 回复此楼
加油~~~
5楼2012-12-14 08:17:51
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭