目标反应为Diels-Alder反应。已经将未催化状态下的过渡态结构优化完成并进行了频率计算和IRC路径验证,结果正确。
现在想做多种氨基酸残基通过与底物当中的氢键供体、受体形成氢键来稳定过渡态。(下图图例中底物与我的底物不同,但原理相似)
我的做法是在已优化后过渡态中加入Glu残基后第二次寻找过渡态,但使用DFT b3lyp/6-31g+(d,p)算一个星期也找不到,换用hf/3-21g寻找加了maxcyc=999仍出现L9999错误。
我对催化残基不是很懂,请问各位该如何改进输入文件(初始构型,分子间距以及体系电荷)?[ Last edited by schalke on 2012-12-12 at 12:32 ]