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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？请高手指点
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晶晶（辉县）

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助】MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？请高手指点

Sample Text
MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？
各个参数的意义是什么啊？
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1楼 2011-03-18 08:19:59
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

年年有余

铁杆木虫 (著名写手)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
学校让你一个人坐MS？？？那么贵的东西
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6楼2011-03-18 14:13:31
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普通回帖

wunianleng

金虫 (小有名气)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
我也想知道。
不想“只知其然，而不知其所以然”
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2楼2011-03-18 13:38:06
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zzy870720z

荣誉版主 (文坛精英)
★ ★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-04-04 14:08:02
建议边设置边看help
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3楼2011-03-18 14:06:13
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tangbohejin

木虫之王 (文学泰斗)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by zzy870720z at 2011-03-18 14:06:13:
建议边设置边看help

支持----
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4楼2011-03-18 14:12:19
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年年有余

铁杆木虫 (著名写手)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
做质普不是有老师么，问吗
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5楼2011-03-18 14:12:52
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wazyg

木虫 (正式写手)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
不是很清楚，帮顶。。。
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7楼2011-03-18 14:13:40
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尹珺加油

金虫 (小有名气)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
帮忙顶~
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8楼2011-03-18 18:29:34
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franch

版主 (著名写手)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
看help，，里面有具体的例子，，，   多试试，，， 还有不懂的地方可以再写出来，，
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9楼2011-03-21 11:24:02
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剑魄诗魂

木虫 (正式写手)
★ ★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢热心帮忙 2011-03-21 16:43:18
这么笼统？MS里的版块十来个，参数更是多如牛毛，楼主的意思是不是回帖的每人举个例子？
为了不辜负楼主的金币，我举几个DMol3的参数（我也只会这个）
比如setup——spin unristricted表示不限定自旋，自旋极化（无意外情况就勾了吧）
         ——use symmetry顾名思义就是利用对称性了（如果计算的物质是对称的，那就勾上吧，可以加速运算）
太多了写起来麻烦。。。楼主这么设金币会遭遇灌水大军的。。。
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晶晶（辉县）
11楼2011-03-21 12:16:53
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uuv2010

荣誉版主 (职业作家)
★ ★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢回复 2011-03-21 16:43:30
可以列出来你关心的具体那几个参数，方便讨论
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13楼2011-03-21 13:46:18
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eleven_xu

银虫 (正式写手)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
不太清楚 呵呵
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15楼2011-03-21 14:10:36
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晶晶（辉县）

木虫 (正式写手)

回复多谢

引用回帖:
Originally posted by 剑魄诗魂 at 2011-03-21 12:16:53:
这么笼统？MS里的版块十来个，参数更是多如牛毛，楼主的意思是不是回帖的每人举个例子？
为了不辜负楼主的金币，我举几个DMol3的参数（我也只会这个）
比如setup——spin unristricted表示不限定自旋，自旋极 ...

比如DMOL3里的funcktional里的GGA    LDA以及后面bp  blyp   vwn   等等的
下面的charge 如何计算？
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16楼2011-03-22 12:09:54
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liujie5631

木虫 (小有名气)
★ ★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢交流 2011-03-22 12:31:56
建议你搜下密度泛函理论的博士论文，好多论文里面都写了有关MS里的参数什么意思，每个基组的区别，比如说，陈丽涛，陈文龙？好像是，你自己查查
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17楼2011-03-22 12:18:55
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1006888042

金虫 (正式写手)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
边看边查吧
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19楼2011-03-22 12:58:03
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晶晶（辉县）

木虫 (正式写手)

多谢

引用回帖:
Originally posted by liujie5631 at 2011-03-22 12:18:55:
建议你搜下密度泛函理论的博士论文，好多论文里面都写了有关MS里的参数什么意思，每个基组的区别，比如说，陈丽涛，陈文龙？好像是，你自己查查

多谢啊
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20楼2011-03-23 08:21:20
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sdsdlgh

银虫 (初入文坛)
★ ★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
sunyang1988(金币+1): 谢谢提示 2011-03-26 20:33:41
引用回帖:
Originally posted by 晶晶（辉县） at 2011-03-18 08:19:59:
Sample Text
MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？
各个参数的意义是什么啊？

问的不够清楚，可以捡着很不懂的地方大家讨论。优化的部分参数容易理解吧
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21楼2011-03-26 09:35:31
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franch

版主 (著名写手)
★
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-04-01 10:31:31
引用回帖:
Originally posted by 晶晶（辉县） at 2011-03-22 12:09:54:
比如DMOL3里的funcktional里的GGA    LDA以及后面bp  blyp   vwn   等等的
下面的charge 如何计算？

这些简单的概念在 help里面都有的，，  你输入关键词即可，，，


深入的资料很多，，，查相关作者的文章即可
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22楼2011-03-30 18:44:57
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sushuo

铜虫 (小有名气)
★ ★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-04-01 10:31:41
引用回帖:
Originally posted by 晶晶（辉县） at 2011-03-18 08:19:59:
Sample Text
MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？
各个参数的意义是什么啊？

MS 过渡态搜索TS Search
Set up: Task中可视需要选择过渡态搜索、优化或确认。
Functional：选择计算方法，一般用GGA，可参考文献选择。
Spin unrestricted: 自旋非限制。

Electronic：
Core treatment: 如果计算体系中含有21号及以后的元素，应选择Effect Core Potentials
Basis set: 选择基组。MIN到TNP，计算精度依次提高。至少采用默认值基组DND，或更高精度DNP、TNP等。

Properties:
Frequency是必选的一项。其他选项则依据自己的计算任务和目的选择。

Job control:
连接服务器计算或进行单机计算。

希望对你有所帮助！·
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晶晶（辉县）
23楼2011-03-31 16:03:05
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sushuo

铜虫 (小有名气)
★
gzqdyouxia(金币+1): 谢谢提示 2011-04-01 10:32:01
引用回帖:
Originally posted by 晶晶（辉县） at 2011-03-18 08:19:59:
Sample Text
MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？
各个参数的意义是什么啊？

其他参数，可以选择默认值。如果不能满足需要，可参考Help 中的Tutorial 相关资料，依据自己的计算体系进行更改。
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24楼2011-03-31 16:05:15
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sushuo

铜虫 (小有名气)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-04-04 13:56:12
引用回帖:
Originally posted by 晶晶（辉县） at 2011-03-18 08:19:59:
Sample Text
MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？
各个参数的意义是什么啊？

关于计算过渡态的各个参数设定方式及意义，建议你截取图片或把具体的参数提供出来，好帮你分析。
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25楼2011-03-31 16:07:24
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liancsh

铜虫 (小有名气)
★
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
引用回帖:
Originally posted by sushuo at 2011-03-31 16:03:05:
MS 过渡态搜索TS Search
Set up: Task中可视需要选择过渡态搜索、优化或确认。
Functional：选择计算方法，一般用GGA，可参考文献选择。
Spin unrestricted: 自旋非限制。

Electronic：
Core treatment ...

我一直对“如何选择赝势进行核心处理”很迷惑，因此想问一下你下面这种说法的依据是什么？
Core treatment: 如果计算体系中含有21号及以后的元素，应选择Effect Core Potentials
请多多指教
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26楼2011-04-04 16:45:06
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sushuo

铜虫 (小有名气)
★ ★
zzy870720z(金币+2): 谢谢交流 2011-04-05 13:38:46
引用回帖:
Originally posted by liancsh at 2011-04-04 16:45:06:
我一直对“如何选择赝势进行核心处理”很迷惑，因此想问一下你下面这种说法的依据是什么？
Core treatment: 如果计算体系中含有21号及以后的元素，应选择Effect Core Potentials
请多多指教

All Electron 通过全电子计算，并且考虑内层电子的作用。
Effect Core Potentials 采用等效势来代替内层电子的作用.
基于21号及以后的原子内层电子数增多，计算量激增，故采用等效势近似处理。
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27楼2011-04-05 09:29:08
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晶晶（辉县）

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
1224381楼: Originally posted by sushuo at 2011-03-31 16:03:05
MS 过渡态搜索TS Search
Set up: Task中可视需要选择过渡态搜索、优化或确认。
Functional：选择计算方法，一般用GGA，可参考文献选择。
Spin unrestricted: 自旋非限制。

Electronic：
Core treatment: 如 ...

你好，由于小木虫求助较少，没及时赠送金币，不好意思啊。。不过多谢多谢了
赞一下 回复此楼
28楼2012-11-14 09:53:43
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晶晶（辉县）

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
900022楼: Originally posted by 剑魄诗魂 at 2011-03-21 12:16:53
这么笼统？MS里的版块十来个，参数更是多如牛毛，楼主的意思是不是回帖的每人举个例子？
为了不辜负楼主的金币，我举几个DMol3的参数（我也只会这个）
比如setup——spin unristricted表示不限定自旋，自旋极化 ...

谢谢，我也用的是DMOL3的。
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29楼2012-11-14 09:55:19
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yuhongquan780810楼
2011-03-21 11:34   回复  
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复，请尊重发帖人，相信你也不想在求助时大家都纯表回复吧，谢谢合作，警告一次 2011-04-05 13:38:01
太阳谷12楼
2011-03-21 12:17   回复  
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
顶一下
zyxme14楼
2011-03-21 13:59   回复  
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
gzqdyouxia: 禁止纯表，鼓励交流，谢谢您的支持和理解 2011-03-22 12:31:46
jqb04078918楼
2011-03-22 12:36   回复  
晶晶（辉县）(金币+2):谢谢参与
zzy870720z: 请不要在悬赏贴中纯表回复，请尊重发帖人，相信你也不想在求助时大家都纯表回复吧，谢谢合作，警告一次 2011-04-05 13:38:20
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