24小时热门版块排行榜    

查看: 2700  |  回复: 7

小木虫于

金虫 (正式写手)

[求助] 结构优化 siesta 和 vasp

用vasp和siesta优化一个结构,结果差了很多。这是怎么回事,有人碰到过么?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lu_wei07

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-12-20 10:25:43
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:01:40
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:02:30
你确定用的参数一样?
另外vasp 确实更精确,毕竟平面波展开更细腻啊
这只是一场游戏
2楼2012-12-20 06:51:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-20 06:51:03
你确定用的参数一样?
另外vasp 确实更精确,毕竟平面波展开更细腻啊

1、 vasp采用paw赝势,pbe交换关联。
2、 siesta采用KB形式的norm-conserving赝势,pbe交换关联。

用以上两种方式优化双层石墨烯参杂,发现,siesta给出比较好的层间距(三点几埃),而vasp给出四点几埃。

以前文献指出,石墨层间距用lda能给出较好的描述,但是gga给出的偏大。当然最好的结果是考虑了vdw作用。

这里siesta用pbe和kb型赝势组合却给出了较好的描述。

以上是我的结果。
3楼2012-12-20 08:42:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lu_wei07

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:01:51
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小木虫于 at 2012-12-20 08:42:55
1、 vasp采用paw赝势,pbe交换关联。
2、 siesta采用KB形式的norm-conserving赝势,pbe交换关联。

用以上两种方式优化双层石墨烯参杂,发现,siesta给出比较好的层间距(三点几埃),而vasp给出四点几埃。

...

你确定vasp收敛了吗。用vasp 之前首先要测试Ecut,另外你siesta的电子温度取多少,vasp又用的什么类型的展宽即ismear,sigma,关于siesta你测试过Pao,energyshift 吗,等都是考虑的因素,从收敛角度上说,vasp收敛的更好,但是局域性上来说siesta更好,毕竟是原子轨道展开,石墨烯层之间的距离用LDA或者GGA 可以吗?这个我不是很确定,可能要用到范德瓦尔斯吧,如果牵扯到范德瓦尔斯那这两个软件都无能为力,虽然他有,但结果不好
这只是一场游戏
4楼2012-12-21 18:00:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-21 18:00:52
你确定vasp收敛了吗。用vasp 之前首先要测试Ecut,另外你siesta的电子温度取多少,vasp又用的什么类型的展宽即ismear,sigma,关于siesta你测试过Pao,energyshift 吗,等都是考虑的因素,从收敛角度上说,vasp收敛的更 ...

vasp的平面波截断没有问题的,这个是无数人应用的,vasp的电子占据方法,和费米面附近展宽这个应该可以放心,按照我的经验不会有问题。siesta的实空间网格用的和相识体系文献的也是一样的,至于轨道大小用的是dzp,局域程度用的默认值。石墨层间用vasp,lda能得到较好的结果这个是文献已经得到的结果(carbon 44 231)。
再有就是这两个软件都可以实现vdw。
5楼2012-12-22 08:40:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-21 18:00:52
你确定vasp收敛了吗。用vasp 之前首先要测试Ecut,另外你siesta的电子温度取多少,vasp又用的什么类型的展宽即ismear,sigma,关于siesta你测试过Pao,energyshift 吗,等都是考虑的因素,从收敛角度上说,vasp收敛的更 ...

siesta关于轨道的测试确实没有做,对这个还不是很理解,也不太懂如何测试,测试标准如何。望赐教。
6楼2012-12-22 10:23:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

quby7503

银虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:02:06
曾经遇到过,现在说一个可能性:
VASP做结构优化,默认的情况下是保持结构的对称性不变的,SIESTA做结构优化,默认的情况下是不保持的,也就是说有可能从输入时的立方结构优化成对称性较低的结构
7楼2012-12-22 11:17:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lu_wei07

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:02:15
引用回帖:
6楼: Originally posted by 小木虫于 at 2012-12-22 10:23:22
siesta关于轨道的测试确实没有做,对这个还不是很理解,也不太懂如何测试,测试标准如何。望赐教。...

所有的 测试最终都是看能量是不是最低
这只是一场游戏
8楼2012-12-22 13:46:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小木虫于 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 311求调剂 +4 冬十三 2026-03-18 4/200 2026-03-18 21:47 by 尽舜尧1
[考研] 321求调剂 +3 何润采123 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:27 by li123456789.
[考研] 08工科 320总分 求调剂 +5 梨花珞晚风 2026-03-17 5/250 2026-03-18 14:49 by haxia
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +6 薛云鹏 2026-03-13 6/300 2026-03-18 14:14 by 脱颖而出
[考研] 302求调剂 +10 呼呼呼。。。。 2026-03-17 10/500 2026-03-18 12:45 by Linda Hu
[考研] 268求调剂 +6 简单点0 2026-03-17 6/300 2026-03-18 09:04 by 无际的草原
[考研] 278求调剂 +5 烟火先于春 2026-03-17 5/250 2026-03-18 08:43 by 星空星月
[基金申请] 被我言中:新模板不强调格式了,假专家开始管格式了 +4 beefly 2026-03-14 4/200 2026-03-17 22:04 by 黄鸟于飞Chao
[考研] 考研求调剂 +3 橘颂. 2026-03-17 4/200 2026-03-17 21:43 by 有只狸奴
[考研] 268求调剂 +7 好运连绵不绝 2026-03-12 8/400 2026-03-17 20:28 by xilongliang
[考研] 考研化学学硕调剂,一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考博] 26申博 +4 八6八68 2026-03-16 4/200 2026-03-17 13:00 by 轻松不少随
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 材料与化工(0856)304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 材料与化工求调剂一志愿 985 总分 295 +8 dream…… 2026-03-12 8/400 2026-03-13 22:17 by 星空星月
信息提示
请填处理意见