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小木虫于

金虫 (正式写手)

[求助] 结构优化 siesta 和 vasp

用vasp和siesta优化一个结构,结果差了很多。这是怎么回事,有人碰到过么?
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lu_wei07

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-12-20 10:25:43
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:01:40
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:02:30
你确定用的参数一样?
另外vasp 确实更精确,毕竟平面波展开更细腻啊
这只是一场游戏
2楼2012-12-20 06:51:03
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小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-20 06:51:03
你确定用的参数一样?
另外vasp 确实更精确,毕竟平面波展开更细腻啊

1、 vasp采用paw赝势,pbe交换关联。
2、 siesta采用KB形式的norm-conserving赝势,pbe交换关联。

用以上两种方式优化双层石墨烯参杂,发现,siesta给出比较好的层间距(三点几埃),而vasp给出四点几埃。

以前文献指出,石墨层间距用lda能给出较好的描述,但是gga给出的偏大。当然最好的结果是考虑了vdw作用。

这里siesta用pbe和kb型赝势组合却给出了较好的描述。

以上是我的结果。
3楼2012-12-20 08:42:55
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lu_wei07

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:01:51
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小木虫于 at 2012-12-20 08:42:55
1、 vasp采用paw赝势,pbe交换关联。
2、 siesta采用KB形式的norm-conserving赝势,pbe交换关联。

用以上两种方式优化双层石墨烯参杂,发现,siesta给出比较好的层间距(三点几埃),而vasp给出四点几埃。

...

你确定vasp收敛了吗。用vasp 之前首先要测试Ecut,另外你siesta的电子温度取多少,vasp又用的什么类型的展宽即ismear,sigma,关于siesta你测试过Pao,energyshift 吗,等都是考虑的因素,从收敛角度上说,vasp收敛的更好,但是局域性上来说siesta更好,毕竟是原子轨道展开,石墨烯层之间的距离用LDA或者GGA 可以吗?这个我不是很确定,可能要用到范德瓦尔斯吧,如果牵扯到范德瓦尔斯那这两个软件都无能为力,虽然他有,但结果不好
这只是一场游戏
4楼2012-12-21 18:00:52
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小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-21 18:00:52
你确定vasp收敛了吗。用vasp 之前首先要测试Ecut,另外你siesta的电子温度取多少,vasp又用的什么类型的展宽即ismear,sigma,关于siesta你测试过Pao,energyshift 吗,等都是考虑的因素,从收敛角度上说,vasp收敛的更 ...

vasp的平面波截断没有问题的,这个是无数人应用的,vasp的电子占据方法,和费米面附近展宽这个应该可以放心,按照我的经验不会有问题。siesta的实空间网格用的和相识体系文献的也是一样的,至于轨道大小用的是dzp,局域程度用的默认值。石墨层间用vasp,lda能得到较好的结果这个是文献已经得到的结果(carbon 44 231)。
再有就是这两个软件都可以实现vdw。
5楼2012-12-22 08:40:49
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小木虫于

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lu_wei07 at 2012-12-21 18:00:52
你确定vasp收敛了吗。用vasp 之前首先要测试Ecut,另外你siesta的电子温度取多少,vasp又用的什么类型的展宽即ismear,sigma,关于siesta你测试过Pao,energyshift 吗,等都是考虑的因素,从收敛角度上说,vasp收敛的更 ...

siesta关于轨道的测试确实没有做,对这个还不是很理解,也不太懂如何测试,测试标准如何。望赐教。
6楼2012-12-22 10:23:22
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quby7503

银虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:02:06
曾经遇到过,现在说一个可能性:
VASP做结构优化,默认的情况下是保持结构的对称性不变的,SIESTA做结构优化,默认的情况下是不保持的,也就是说有可能从输入时的立方结构优化成对称性较低的结构
7楼2012-12-22 11:17:19
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lu_wei07

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小木虫于: 金币+2, 有帮助 2013-01-28 21:02:15
引用回帖:
6楼: Originally posted by 小木虫于 at 2012-12-22 10:23:22
siesta关于轨道的测试确实没有做,对这个还不是很理解,也不太懂如何测试,测试标准如何。望赐教。...

所有的 测试最终都是看能量是不是最低
这只是一场游戏
8楼2012-12-22 13:46:22
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