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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 哪里可以查植物基因组DNA大小及相关信息
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

[求助] 哪里可以查植物基因组DNA大小及相关信息

最近在做枇杷叶的DNA 可是不知道哪里可以查植物基因组DNA大小及相关信息，求帮忙！
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haha
1楼 2012-11-26 21:23:24
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liaoshibo

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
植物基因比人的大很多，我才看的一篇文章说，现在植物DNA一直序列极少。是一个有待研究的领域。
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我就是我，你也是你。勿模仿，自超越。
2楼2012-11-26 21:47:14
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haitian0625

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NCBI没有植物的吗？
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下雨的傍晚
3楼2012-11-26 23:40:51
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by haitian0625 at 2012-11-26 23:40:51
NCBI没有植物的吗？

怎么查啊！我是在NCBI主页选择Nucleotide 在检索框中输入植物英文名，出来的没有总DNA的相关信息啊？求解中！
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haha
4楼2012-11-27 09:13:50
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seanzhu1996

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
NCBI应该有的啊，或者google一下看看，有没有相关的文献信息。
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享受每天的生活
5楼2012-11-27 10:07:08
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
总DNA太大了，楼主还不如查染色体了，建议找到要研究的那个基因的名称，这样NCBI上会有。祝成功～
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下雨的傍晚
6楼2012-11-27 10:28:32
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-27 10:28:32
总DNA太大了，楼主还不如查染色体了，建议找到要研究的那个基因的名称，这样NCBI上会有。祝成功～

我的目的是想知道总基因大概多大，还有就是之后设计特异性引物，要怎么查呢？知道DNA甲基化敏感扩增多态性的引物以及接头怎么选择吗？
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haha
7楼2012-11-27 10:32:03
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by seanzhu1996 at 2012-11-27 10:07:08
NCBI应该有的啊，或者google一下看看，有没有相关的文献信息。

没有啊，只查到一些微卫星及mRNA的!
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haha
8楼2012-11-27 10:33:19
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CXL19880406

木虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 下雨的傍晚 at 2012-11-27 10:32:03
我的目的是想知道总基因大概多大，还有就是之后设计特异性引物，要怎么查呢？知道DNA甲基化敏感扩增多态性的引物以及接头怎么选择吗？...

跟楼主很有缘哪，我就是做MSAP的。之前用的引物是实验室传下来的，用在了水稻的几个不同品种，还有小鼠，结果都是很不错的。需要的话可以给楼主参考一下。如果自己设计接头的话需要考虑酶切位点，要用限制性内切酶，平切酶试过了，接头接不上，并且要注意两条链的接头序列要对上，别弄反了；另一个引物是实验室传下来的，当时记得怎么设计的，现在忘了。不知道楼主要总基因组干嘛，如果做MSAP的话可以不考虑啊，我当时也没查过。
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下雨的傍晚
9楼2012-11-27 10:54:50
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-27 10:54:50
跟楼主很有缘哪，我就是做MSAP的。之前用的引物是实验室传下来的，用在了水稻的几个不同品种，还有小鼠，结果都是很不错的。需要的话可以给楼主参考一下。如果自己设计接头的话需要考虑酶切位点，要用限制性内切酶 ...

,真的很高兴啊，你做过就可以教教我了！我是学药的，对这些一点都不懂，现在是还在摸索提DNA阶段，提了有快两周了，一直提不好啊，帮我分析分析呗！是用的改良CTAB法。想知道总基因是跑电泳时不知道哪个是，引物序列是问做过DNA的人怎么设计引物的人家说要知道序列才能设计的。看文献人家做的就很纳闷人家的特异性引物以及接头怎么选择的！下面是我前两天做的电泳，帮帮忙啊！

IMG_20121123_103631.jpg



IMG_20121126_165828.jpg
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haha
10楼2012-11-27 11:04:47
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