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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
下雨的傍晚: 金币+5, ★★★很有帮助, 耐心的帮我解答问题 2012-11-28 11:55:40
引用回帖:
10楼: Originally posted by 下雨的傍晚 at 2012-11-27 11:04:47
,真的很高兴啊,你做过就可以教教我了!我是学药的,对这些一点都不懂,现在是还在摸索提DNA阶段,提了有快两周了,一直提不好啊,帮我分析分析呗!是用的改良CTAB法。想知道总基因是跑电泳时不知道哪个是, ...

图1最亮的那个应该是,最下面那一行条带不是吧,我没出过这样的结果。不知道你这6个样品是不是相同质量的,怎么前3个和后3个差那么多。我用的上海生工的试剂盒提的,先把原理搞透可以适当对试剂盒的步骤进行改良,拖尾降解一些没关系,毕竟后面要设计引物只扩增你想要的东西就行了。图2没看懂啊……

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11楼2012-11-27 11:16:33
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-27 11:16:33
图1最亮的那个应该是,最下面那一行条带不是吧,我没出过这样的结果。不知道你这6个样品是不是相同质量的,怎么前3个和后3个差那么多。我用的上海生工的试剂盒提的,先把原理搞透可以适当对试剂盒的步骤进行改良, ...

图1 ,是两个样品,是用CTAB法做的,没有用试剂盒!我现在提的都没信心了。那你可以跟我讲讲你们做的过程吗以及要提到怎么个程度就可以了?是1,提DNA 2,MSAP双酶切体 3,MSAP预扩增体系 4,MSAP,选择性扩增体系这只是我知道的大概,很多细节我都不知道,麻烦介绍几篇有关MSAP的综述让我了解呗!我非常感谢!
haha
12楼2012-11-27 11:28:46
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

只留图1的亮带就行,稍微拖尾没关系。具体步骤也太多了,没法跟你说啊,大概就是裂解,除RNA,回BUFFER PP(忘了什么作用了),异丙醇沉降,乙醇洗涤。文章的话网上有很多啊,中国知网最简单的,我们一般用的是NCBI,springerlink和sciencedirect(老师不让看中文),搜MSAP肯定有
13楼2012-11-27 11:57:02
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-27 11:57:02
只留图1的亮带就行,稍微拖尾没关系。具体步骤也太多了,没法跟你说啊,大概就是裂解,除RNA,回BUFFER PP(忘了什么作用了),异丙醇沉降,乙醇洗涤。文章的话网上有很多啊,中国知网最简单的,我们一般用的是NCBI ...

在知网里查过,但是很有限!那我就只好硬着头皮看外文了!对了你们用的接头和引物是什么,可否告知呢?
haha
14楼2012-11-27 16:45:24
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

引用回帖:
13楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-27 11:57:02
只留图1的亮带就行,稍微拖尾没关系。具体步骤也太多了,没法跟你说啊,大概就是裂解,除RNA,回BUFFER PP(忘了什么作用了),异丙醇沉降,乙醇洗涤。文章的话网上有很多啊,中国知网最简单的,我们一般用的是NCBI ...

帮忙看一下我提取的步骤呗!
1,称0.2-0.5g叶于预冷的研钵中快速研磨(研磨中加有10mg左右的PVP),研细后加入1ml的提取缓冲液(100mmol/l Tris-Hcl,50mmol/ledta,700mmol/lNacl,2%巯基乙醇,2%PVP)摇匀,在冰上静置10min.
2,取出离心管5000r/min 10min,去上清,加1ml预热的裂解缓冲液(100mmol/l Tris-Hcl,20mmol/ledta,1.4mol/lNacl,2%巯基乙醇,2%PVP,4%CTAB)混匀,于65度水浴锅中水浴1h,期间轻轻颠倒混匀数次。
3,取出离心管冷却至室温,12000r/mim 10min离心。
4,将上清转入新的离心管中加等体积的氯仿/异戊醇混匀,12000r/mim 10min离心。
5,去上清加等体积的酚/氯仿/异戊醇,混匀,12000r/mim 10min离心。
6,将上清转入新的离心管中加等体积的氯仿/异戊醇混匀,12000r/mim 10min离心。
7,取上清,加入100ul5mol/lNacl,再加2倍体积预冷的无水乙醇,颠倒混匀。放入-20度冰箱静止30min后,12000r/mim 10min离心。
8,沉淀用70%,及无水乙醇各洗两次,各10min 左右。
9,风干后加TE溶解!
haha
15楼2012-11-27 17:05:10
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我没做第一步,我研磨后直接加裂解液置于冰上,等所有样品都研磨完以后一起水浴裂解,隔10分钟振荡一次使其充分裂解;另外我用的是异丙醇沉降,乙醇洗的。因为我的样品少,我沉降2个小时,有些降解,但是提出的效果还是挺好的。之前的那些试剂因为是跟试剂盒走的,所以不敢乱说。希望对你有帮助~

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16楼2012-11-28 09:06:27
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
16楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-28 09:06:27
我没做第一步,我研磨后直接加裂解液置于冰上,等所有样品都研磨完以后一起水浴裂解,隔10分钟振荡一次使其充分裂解;另外我用的是异丙醇沉降,乙醇洗的。因为我的样品少,我沉降2个小时,有些降解,但是提出的效果 ...

那你们的DNA中如果有RNA的话会影响吗?还是一定要除去?
haha
17楼2012-11-28 09:43:09
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

嗯,加RNA酶处理过了,不然OD值差太多

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18楼2012-11-28 09:54:23
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
18楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-28 09:54:23
嗯,加RNA酶处理过了,不然OD值差太多

我DNA 得至少放3-4个月,后续摸条件而且有24个样品,加RNA酶对后面的DNA会有影响吗?
haha
19楼2012-11-28 10:40:14
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
19楼: Originally posted by 下雨的傍晚 at 2012-11-28 10:40:14
我DNA 得至少放3-4个月,后续摸条件而且有24个样品,加RNA酶对后面的DNA会有影响吗?...

不会。DNA原液储存,可取出少量稀释配成工作液备常用。

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20楼2012-11-28 11:03:22
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