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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

[求助] 哪里可以查植物基因组DNA大小及相关信息

最近在做枇杷叶的DNA 可是不知道哪里可以查植物基因组DNA大小及相关信息,求帮忙!
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haha
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liaoshibo

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
植物基因比人的大很多,我才看的一篇文章说,现在植物DNA一直序列极少。是一个有待研究的领域。
我就是我,你也是你。勿模仿,自超越。
2楼2012-11-26 21:47:14
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haitian0625

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NCBI没有植物的吗?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2012-11-26 23:40:51
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by haitian0625 at 2012-11-26 23:40:51
NCBI没有植物的吗?

怎么查啊!我是在NCBI主页选择Nucleotide 在检索框中输入植物英文名,出来的没有总DNA的相关信息啊?求解中!
haha
4楼2012-11-27 09:13:50
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seanzhu1996

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NCBI应该有的啊,或者google一下看看,有没有相关的文献信息。
享受每天的生活
5楼2012-11-27 10:07:08
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
总DNA太大了,楼主还不如查染色体了,建议找到要研究的那个基因的名称,这样NCBI上会有。祝成功~

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2012-11-27 10:28:32
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-27 10:28:32
总DNA太大了,楼主还不如查染色体了,建议找到要研究的那个基因的名称,这样NCBI上会有。祝成功~

我的目的是想知道总基因大概多大,还有就是之后设计特异性引物,要怎么查呢?知道DNA甲基化敏感扩增多态性的引物以及接头怎么选择吗?
haha
7楼2012-11-27 10:32:03
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by seanzhu1996 at 2012-11-27 10:07:08
NCBI应该有的啊,或者google一下看看,有没有相关的文献信息。

没有啊,只查到一些微卫星及mRNA的!
haha
8楼2012-11-27 10:33:19
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 下雨的傍晚 at 2012-11-27 10:32:03
我的目的是想知道总基因大概多大,还有就是之后设计特异性引物,要怎么查呢?知道DNA甲基化敏感扩增多态性的引物以及接头怎么选择吗?...

跟楼主很有缘哪,我就是做MSAP的。之前用的引物是实验室传下来的,用在了水稻的几个不同品种,还有小鼠,结果都是很不错的。需要的话可以给楼主参考一下。如果自己设计接头的话需要考虑酶切位点,要用限制性内切酶,平切酶试过了,接头接不上,并且要注意两条链的接头序列要对上,别弄反了;另一个引物是实验室传下来的,当时记得怎么设计的,现在忘了。不知道楼主要总基因组干嘛,如果做MSAP的话可以不考虑啊,我当时也没查过。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

9楼2012-11-27 10:54:50
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下雨的傍晚

新虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
9楼: Originally posted by CXL19880406 at 2012-11-27 10:54:50
跟楼主很有缘哪,我就是做MSAP的。之前用的引物是实验室传下来的,用在了水稻的几个不同品种,还有小鼠,结果都是很不错的。需要的话可以给楼主参考一下。如果自己设计接头的话需要考虑酶切位点,要用限制性内切酶 ...

,真的很高兴啊,你做过就可以教教我了!我是学药的,对这些一点都不懂,现在是还在摸索提DNA阶段,提了有快两周了,一直提不好啊,帮我分析分析呗!是用的改良CTAB法。想知道总基因是跑电泳时不知道哪个是,引物序列是问做过DNA的人怎么设计引物的人家说要知道序列才能设计的。看文献人家做的就很纳闷人家的特异性引物以及接头怎么选择的!下面是我前两天做的电泳,帮帮忙啊!

IMG_20121123_103631.jpg



IMG_20121126_165828.jpg

haha
10楼2012-11-27 11:04:47
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