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zhangyonghu

木虫 (小有名气)

[求助] AFLP的欲扩范围大

我最近做AFLP,DNA里含点蛋白质,用PSTI和MSEI双酶切,可是欲扩以后在750那有一条亮带,弥散的范围也偏大,是怎么回事
是不是蛋白质对酶切存在影响,怎么能把蛋白质除掉呢
这是我的欲扩的图

未命名.jpg
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CXL19880406

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
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小丹木木: 金币+4, 鼓励应助 2012-11-26 18:52:25
首先,DNA里含蛋白是测的OD值发现的么?如果是用CTAB法的话有可能是酚没除净,但是如果做AFLP的话DNA的纯度是可以适当放低的,毕竟之后你要设计引物,PCR只按你的引物来扩增,蛋白影响不大的;其次,不知道你做的是什么DNA,我做的水稻预扩弥散一片,完全是没有条带的,但是做了选扩以后,条带就特别清晰很漂亮,我的老师告诉我在预扩过程中没有条带都是正常的,正常操作来讲是不需要跑胶的,建议你可以接着往下做选扩试试。祝好运~
7楼2012-11-26 11:10:31
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liugs

禁虫 (正式写手)

感谢参与,应助指数 +1
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2楼2012-11-26 06:42:21
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shucanwei

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
先把核酸质量搞上去先。核酸的OD值是多少?0  去蛋白的方法有多种:用蛋白酶K;用酚抽提;用试剂盒抽提。第三种最方便且毒性小。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
唯以一人治天下,不以天下奉一人。
3楼2012-11-26 07:25:36
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shucanwei

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

你是提植物的吗?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
唯以一人治天下,不以天下奉一人。
4楼2012-11-26 07:26:40
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