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mdcrd文件出现问题
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跑CUDA的时候，输入文件没有错，因为其他体系用的同样的格式。计算结果也显示的是跑完了。但是在计算RMSD的时候，在一段时间过后突然变成零值。后来在服务器之间传递mdcrd文件时，传递一段之后，也显示错误。这种情况应该怎么解决呢？我用同样的输入文件，对同一个体系跑了两次，第二次的轨迹文件做RMSD的时候比第一个多跑了5NS，但还是掉到零了。图中红色的是第一次跑的RMSD,黑色是第二次跑的。同一个体系，同一个输入文件。。。。这是为什么呢？怎么解决呢？？？求高手指点啊 wat.jpg |
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yaozhq
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