应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » g03 or g09 临时文件存放问题
81/1返回列表
查看: 2376  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

sunmuer

木虫 (小有名气)

[求助] g03 or g09 临时文件存放问题

我的g09安装目录为/home/g09
g09里也建立了个scratch目录
程序可以运行，临时文件都存在scratch里
现在我想让每个用户在使用g09进行计算时，产生的临时文件不存在scratch目录下，而是存在提交任务的当前目录，这样方便每个用户自己及时删除这些临时文件。
请问是将 export GAUSS_SCRDIR=/home/g09/scratch
这句话删除，还是？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Linux，高斯等相关知识

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
出清水而不染
1楼 2012-04-05 10:24:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zrtpaopao

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-04-05 18:18:00
sunmuer: 金币+2, ★有帮助, 回头我试试看 2012-04-06 06:49:51
删除
计算的临时文件就放在当前目录了
赞一下 回复此楼
2楼2012-04-05 12:11:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sunmuer: 金币+1, ★有帮助, 能说说为什么吗？ 2012-04-06 06:50:14
如果是这样的话，只需要2～3个高斯，你的集群就基本瘫患。
赞一下 回复此楼
3楼2012-04-05 20:11:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunmuer

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by bluewhale at 2012-04-05 20:11:52:
如果是这样的话，只需要2～3个高斯，你的集群就基本瘫患。

为什么呢？
回复此楼
出清水而不染
4楼2012-04-06 06:49:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

不喜欢豆芽

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
sunmuer: 金币+3, ★有帮助, 谢谢解答 2012-04-06 12:05:17
如果你的空间足够大的话，还可以，不够大的话很容易满的，临时文件很大的，尤其是rwf文件，不过你可以在输入文件中将没用的临时文件不保存，如：
%rwf=
%nosave
这样的话，nosave上面的都不会保存，你可以看一下manual，很清楚的，关于scratch文件的。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-04-06 09:22:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunmuer

木虫 (小有名气)
我删除了那一行以后，提交任务时出现下列问题：

PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /usr/local/g09/scratch/Gau-4938.inp
In source file ml0.f, at line number 182
  --- traceback not available

[1]+  Aborted                 g09 ts2a-ny.com
赞一下 回复此楼
出清水而不染
6楼2012-04-06 09:52:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunmuer

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zrtpaopao at 2012-04-05 12:11:15:
删除
计算的临时文件就放在当前目录了

删除以后，提交任务时出现了一个新的问题
PGFIO/stdio: No such file or directory
PGFIO-F-/OPEN/unit=11/error code returned by host stdio - 2.
File name = /usr/local/g09/scratch/Gau-4938.inp
In source file ml0.f, at line number 182
  --- traceback not available

[1]+  Aborted                 g09 ts2a-ny.com

我的g09装在/home下的，为什么会找 /usr/local/下的g09呢？
赞一下 回复此楼
出清水而不染
7楼2012-04-06 12:07:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bluewhale

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by sunmuer at 2012-04-06 06:49:28:
为什么呢？

scratch的目的是要求一个速度快的本地存储，一般来讲，g03/g09会不断地交换内存与scratch文件的内容，对于NFS存储，这种负载显然过大，你可以试一下。当然，现在内存配得都比较大，也可以用内存作scratch,例如，
ln -s /dev/shm /scratchmem
这样，性能将好很多。计算完后，记得清空scratchmem下的临时文件。
赞一下 回复此楼
8楼2012-04-06 12:47:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 sunmuer 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +7 Ncdx123456 2026-03-13 8/400 2026-03-16 12:15 by karry wen
[考研] 283求调剂 +8 小楼。 2026-03-12 11/550 2026-03-16 09:46 by 无际的草原
[考研] 0703化学调剂 +4 妮妮ninicgb 2026-03-15 7/350 2026-03-16 09:43 by 闲人终南山
[考研] 344求调剂 +3 knight344 2026-03-16 3/150 2026-03-16 09:42 by 无际的草原
[考研] 一志愿985，本科211，0817化学工程与技术319求调剂 +4 Liwangman 2026-03-15 4/200 2026-03-16 08:01 by wang_dand
[考研] 材料工程327求调剂 +3 xiaohe12w 2026-03-11 3/150 2026-03-14 20:20 by ms629
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 297求调剂 +4 学海漂泊 2026-03-13 4/200 2026-03-14 11:51 by 热情沙漠
[考研] 求调剂 +3 清风问长安 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:15 by JourneyLucky
[考研] 调剂 +3 13853210211 2026-03-10 3/150 2026-03-14 00:47 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +6 邱gl 2026-03-12 7/350 2026-03-13 23:24 by 邱gl
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 295求调剂 +3 小匕仔汁 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:17 by vgtyfty
[考研] 285求调剂 +4 ytter 2026-03-12 4/200 2026-03-13 14:48 by jxchenghu
[考研] 070303一志愿西北大学学硕310找调剂 +3 d如愿上岸 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:43 by houyaoxu
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +10 我想读研11 2026-03-10 10/500 2026-03-13 10:14 by Yuyi.
[考研] 纺织、生物、化学、材料相关专业招生了 +4 耶耶业 2026-03-09 7/350 2026-03-12 19:05 by Equinoxhua
[考研] 341求调剂 +4 捣蛋猪猪 2026-03-11 4/200 2026-03-12 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭