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xiaoyue1610

木虫 (正式写手)


[求助] 分子距离 确定

请问在高斯里对A和B分子放在一起优化时, A和B分子之间的距离是怎么确定的?我之前看有的说是单独计算每个分子的最高已占有轨道(HOMO)至最低未占有轨道(LUMO),也就是说计算自然键轨道分析(NBO)分析,是这样的吗?在gaussian的哪里可以计算呢?还需要计算啥不?
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xiaoyue1610

木虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-10-24 11:17:35
这个需要根据你具体的体系来算的。你需要先分析相关的作用力,然后把分子放在合适的角度位置,然后进行优化即可...

相关作用力不确定呢是啥呢?我这只计算了单个分子的OPT,FRE,其他的没计算,不知道还需要计算啥。
7楼2012-10-25 00:49:22
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaoyue1610: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-10-26 11:52:47
放在一起优化主要考虑分子间的弱相互作用,如氢键,派派堆积等,静电作用等。可以尝试一下加上色散校正项的计算
2楼2012-10-24 10:17:14
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vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaoyue1610: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-26 11:53:07
对于弱相互作用体系来说,A和B的初始距离对结果影响不大。量化计算可以自动将两者距离从不合理的数值改变到较为合理的数值。
3楼2012-10-24 10:57:23
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xiaoyue1610

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-10-24 10:17:14
放在一起优化主要考虑分子间的弱相互作用,如氢键,派派堆积等,静电作用等。可以尝试一下加上色散校正项的计算

可否在具体一点呢,我刚接触这个,对着个不怎么熟悉?具体我要在哪里计算,他们之间的相对位置如果没有确定的话怎么进行您说的计算呢?可否在详细点,不知道我有没有讲清楚
4楼2012-10-24 10:58:15
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