[求助] 请教关于in cell形式向original形式坐标转化的fortran算法

苦思冥想了一天，没有想到适合的算法，想法是想将一个in cell形式（所有原子在晶格内部）转化为original形式（将原子表示成完整分子形式），请高手指导一个思路，拜谢了 in-cell original 起初的想法是 将距离ADHE面附近一定距离处的原子加上一个晶格长度，与BCGF面内的原子计算距离以确定是否成键；同理，将距离ABEF面附近一定距离处的原子加上一个晶格长度，与CDHG面内的原子计算距离,以确定是否成键。同样的方法处理第三对表面。 但出现的问题是ADHE面附近一定距离处的原子可能与别的原子形成了某个分子上的基团，移动了一个原子，其余原子如何配对跟着移动，这是其一。其二可以看到画出的距离ADHE面和ABEF面的两个小区域会产生一个交集，如果一个分子存在此处并在BA方向上和DA方向各外延出一个原子，如何处理。棘手棘手。 [ Last edited by xk6891 on 2011-6-29 at 15:08 ]

回复此楼

» 猜你喜欢

• 上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士 已经有6人回复
• 带资进组求博导收留 已经有11人回复
• 自荐读博 已经有5人回复
• 求个博导看看 已经有16人回复
• 上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生 已经有4人回复
• 求助院士们，这个如何合成呀 已经有4人回复
• 临港实验室与上科大联培博士招生1名 已经有9人回复
• 写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文，论文内容以实验为主，投什么期刊合适？ 已经有6人回复
• 最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章 已经有11人回复
• 中科院杭州医学所招收博士生一名（生物分析化学、药物递送） 已经有3人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

• 请教如何添加有机过氧化物改善pp 的MFI? 已经有30人回复
• 新人请教两个问题：1.联合培养2年是否可行？2。。。 已经有3人回复
• 2012版申请书二级标题内容的格式问题请教 已经有7人回复
• 请教晶体材料的禁带宽度和激发波长的关系！ 已经有4人回复
• 细胞仿真软件SimCell(已搜索无重复) 已经有23人回复
• MATLAB经典算法程序 已经有531人回复
• Guassian和VASP计算过渡态的原理和算法上差别在哪里？ 已经有9人回复
• nunc细胞工厂也就是Cell Factory使用时怎么消化贴壁细胞？ 已经有4人回复
• C语言与Fortran语言之间的转化 已经有9人回复
• 有没有以邮件形式的投稿方式？？ 已经有5人回复
• 【分享】C/C++常用算法设计方法,fortran其他语言编程也可以参考下 已经有8人回复
• 【求助】有机溶剂之间溶解机理及溶质存在形式 已经有3人回复