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xk6891至尊木虫 (著名写手)
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[求助]
请教关于in cell形式向original形式坐标转化的fortran算法
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苦思冥想了一天，没有想到适合的算法，想法是想将一个in cell形式（所有原子在晶格内部）转化为original形式（将原子表示成完整分子形式），请高手指导一个思路，拜谢了 in-cell  original  起初的想法是 将距离ADHE面附近一定距离处的原子加上一个晶格长度，与BCGF面内的原子计算距离以确定是否成键；同理，将距离ABEF面附近一定距离处的原子加上一个晶格长度，与CDHG面内的原子计算距离,以确定是否成键。同样的方法处理第三对表面。 但出现的问题是ADHE面附近一定距离处的原子可能与别的原子形成了某个分子上的基团，移动了一个原子，其余原子如何配对跟着移动，这是其一。其二可以看到画出的距离ADHE面和ABEF面的两个小区域会产生一个交集，如果一个分子存在此处并在BA方向上和DA方向各外延出一个原子，如何处理。棘手棘手。  [ Last edited by xk6891 on 2011-6-29 at 15:08 ] |
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