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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » CIF专栏 » 【求助】急问有关π-π堆积作用
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zxq1985921

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】急问有关π-π堆积作用 已有7人参与

请问怎么在xp里输入程序计算两个分子之间的距离，从而知道有没有π-π堆积作用？
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qnan
1楼 2010-05-14 22:40:11
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dpzhang

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
wsht212(金币+1):谢谢交流，希望常来！ 2010-05-15 09:05:18
分子之间的距离无法计算，也不科学，可以计算芳环中心之间的距离来看
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生活还要继续
2楼2010-05-14 23:32:22
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dongyang5028

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yanhualover:谢谢交流 2010-05-15 20:48:52
你最好用PLATON计算
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3楼2010-05-15 15:42:46
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zxq1985921

铜虫 (小有名气)
wsht212:谢谢交流，希望常来！ 2010-05-16 17:01:36
引用回帖:
Originally posted by dpzhang at 2010-05-14 23:32:22:
分子之间的距离无法计算，也不科学，可以计算芳环中心之间的距离来看

我知道是计算芳环间的距离，但是不知道输什么指令，在哪里采可以看到？还请多多指教。
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qnan
4楼2010-05-16 16:04:55
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盗版ing

铜虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-05-23 23:59:16
引用回帖:
Originally posted by zxq1985921 at 2010-05-16 16:04:55:

我知道是计算芳环间的距离，但是不知道输什么指令，在哪里采可以看到？还请多多指教。

用HG计算，选中原子，点击caculate  点centro。就确定苯环的中心了。然后测量距离。哈哈
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5楼2010-05-23 23:39:06
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zxq1985921

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 盗版ing at 2010-05-23 23:39:06:

用HG计算，选中原子，点击caculate  点centro。就确定苯环的中心了。然后测量距离。哈哈

用这个方法计算出来的距离和用xp那种输入程序计算出来的好像不一样，这是为什么呢？
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qnan
6楼2010-05-24 16:32:10
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zxq1985921

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by 盗版ing at 2010-05-23 23:39:06:

用HG计算，选中原子，点击caculate  点centro。就确定苯环的中心了。然后测量距离。哈哈

如果用hg长不出很多层，那该怎么办呢？
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qnan
7楼2010-05-24 16:34:20
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盗版ing

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zxq1985921 at 2010-05-24 16:34:20:

如果用hg长不出很多层，那该怎么办呢？

点calculate /packing/点pack那个，修改abc，原来是1改成2或者3等，只要你电脑没问题，想涨多少都可以
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8楼2010-05-25 17:26:42
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yqchen20087678

金虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帝夫(金币+1):感谢回帖交流！ 2010-05-26 15:43:13
最好用platon来计算。这种方法准确度高
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9楼2010-05-26 14:01:42
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wuhz

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
帝夫(金币+2):感谢回帖交流！ 2010-05-27 08:49:31
mercury程序 先产生两个环的中心，然后measure  distance就可以了

产生环心：先select atoms》calculate>centroids>new centroid>ok
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10楼2010-05-26 18:05:46
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