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iRNA的设计问题
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了解iRNA的虫子麻烦回答一下设计过程中的几个问题,万分感谢。 1. 已知TNF-α正义链为5’GACAACCAACUAGUGGUGCdTdT 3’’,它的反义链是怎样的,尤其是dTdT3怎么配对?5’GACAACCAACUAGUGGUGCdTdT 3’’和5’-GAC AAC CAA CUA GUG GUG CUU-3‘有啥区别? 2.网上有这么句话“建议用dTdT取代3′端的2 个碱基突出,增强siRNA 双链复合体的稳定性。需要注意的是,由于双链siRNA中的正义链不参与对靶mRNA的识别,所以正义链的3′端突出碱基可以用dTdT替代,但是反义链3′端突出碱基必需与靶mRNA序列相同的”意思是否说,反义链的3‘端不能把最后两个碱基写成dTdT? 3.GFP siRNA中,5’-GACGUAAACGGCCACAAGUUC-3‘ antisense, 3’-CGCUGCAU-UUGCCGGUGUUCA-5‘, 为什么不完全配对?(已确认不是写错) VEGF siRNA 中, Sense CGAGATAGAGTACATCTTCAA Antisense TTGAAGATGTACTCTATCTCG 为什么RNA中会出现T? |
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