24小时热门版块排行榜    

查看: 5693  |  回复: 5

yiha

新虫 (初入文坛)

[求助] vmd 氢键显示

各位好:
       请问在vmd中如何显示氢键?比如水分子之间的氢键。在selected中输入 H,O,再在drawing methond选择hbond,还是没有氢键
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

我学习计算的一些帖子 VMD 软件 氢键

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhtear99

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-15 16:35:00
在“VMD Main”的“extensions”中,选择“analysis”中的“hydrogen bonds”,会出现一个关于氢键的对话框。还有就是你可以自己用鼠标选中原子,自己连一下,然后看看在整个MD过程中这个氢键距离的变化。
生是过往,跋涉虚无之境
2楼2012-10-15 12:32:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yiha

新虫 (初入文坛)

你好:  
     谢谢回复,我是想显示下所有水之间的氢键,如图中蓝色所示,请问该如何显示?

2450697.png

3楼2012-10-15 14:37:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhtear99

铁杆木虫 (著名写手)

你好,上面的方法不行吗?
生是过往,跋涉虚无之境
4楼2012-10-16 13:53:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhusy87

禁虫 (小有名气)

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-16 16:00:36
本帖内容被屏蔽

5楼2012-10-16 15:50:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yiha

新虫 (初入文坛)

谢谢各位的回复,这些方法我试过了,还是不能显示
6楼2012-10-16 20:02:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yiha 的主题更新
信息提示
请填处理意见