| 查看: 1169 | 回复: 4 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
用Amber跑MD,水跑散了,怎么办呢?
|
||
| 刚刚开始摸Amber,遇到一个问题,就是用leap加入TIP3P水模型,没有加周期性边界条件,在跑平衡的时候,水跑的离分子越来越远,最后跑散了。。我在网上搜,说是需要加限制力,我这个是小有机分子,怎么对它加限制力呢? |
» 猜你喜欢
本人42,博士刚毕业,现在找不到工作,怎么办?:(
已经有18人回复
河北省自然基金
已经有6人回复
博士申请
已经有5人回复
析晶
已经有6人回复
国自然面上和省基金B类撒花
已经有24人回复
26级硕士毕业生求博导收留
已经有6人回复
有人投过CCC中国控制会议吗?
已经有3人回复
3,4-二羟基苯乙酮如何纯化?
已经有5人回复
国基评审
已经有10人回复
2026-博士申请
已经有4人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
CP2K 跑 MD 为什么分子跑到了周期性格子外面
已经有5人回复
请教做MD计算时,蛋白质分子有一部分跑出水盒子
已经有9人回复
【原创】CASTEP下跑MD大模型时碰到的问题及解决方法
已经有5人回复
【求助】跑完MD后,一般都要分析什么东西?
已经有3人回复
5楼2013-07-17 16:52:54
koalabear8655
铁虫 (初入文坛)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 25.8
- 散金: 20
- 帖子: 26
- 在线: 17.7小时
- 虫号: 758507
- 注册: 2009-04-27
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
2楼2012-10-19 17:43:45
yaozhq
金虫 (小有名气)
- 应助: 126 (高中生)
- 金币: 1137.8
- 红花: 7
- 帖子: 260
- 在线: 37.6小时
- 虫号: 1475454
- 注册: 2011-11-04
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2012-10-20 14:08:48
lujunyan1118
金虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1306.9
- 帖子: 73
- 在线: 20.4小时
- 虫号: 871655
- 注册: 2009-10-14
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
4楼2012-10-29 20:15:05












回复此楼
