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zxd95

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 植物转录组测序已有14人参与

最近设计实验,想弄清龙胆苷类代谢途径,首先想到了转录组测序,找代谢相关基因。龙胆的基因组还没有测序,测序后是无参照的。进行转录组测序有什么要求,需要注意哪些问题?可以选用拟南芥做参照进行功能注释吗?希望做过转录组的同志们指点指点,谢谢!
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追梦的人
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德国工兵铲

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
想学习这方面知识,期待高人出现
4楼2012-11-22 23:03:04
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
嗯.............
       木做过,帮顶,挺感兴趣的,希望有高手指点
Let God do with it as He wills
2楼2012-10-05 11:25:46
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crab922

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
没有高手回复呀,我也很想学习这个。
3楼2012-11-22 21:46:00
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gaoyang636

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先暂时把怎么分析这个问题放到一边,先请教一下这个实验打算怎么设计呢?
目的已经明确了:龙胆(物种)苷类代谢途径(对象)
那么:你手头是有这个苷类代谢的 异常表型(突变)株么? 还是 通过某种刺激可以实现 明显改变这个苷类代谢途径?
如果都没有,仅仅是有这个植物……那么直接测个转录组|蛋白组,甚至基因组,对研究某个很具体的途径来说,都不会有多么好的提示作用。
大体意思其实就是:得有个对照组+实验组的组合
5楼2012-11-23 08:56:11
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