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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 植物转录组测序
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zxd95

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 植物转录组测序 已有14人参与

最近设计实验，想弄清龙胆苷类代谢途径，首先想到了转录组测序，找代谢相关基因。龙胆的基因组还没有测序，测序后是无参照的。进行转录组测序有什么要求，需要注意哪些问题？可以选用拟南芥做参照进行功能注释吗？希望做过转录组的同志们指点指点，谢谢！
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追梦的人
1楼 2012-10-05 11:07:57
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crab922

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
没有高手回复呀，我也很想学习这个。
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3楼2012-11-22 21:46:00
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atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
嗯.............
       木做过，帮顶，挺感兴趣的，希望有高手指点
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Let God do with it as He wills
2楼2012-10-05 11:25:46
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德国工兵铲

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
想学习这方面知识，期待高人出现
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4楼2012-11-22 23:03:04
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gaoyang636

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
先暂时把怎么分析这个问题放到一边，先请教一下这个实验打算怎么设计呢？
目的已经明确了：龙胆（物种）苷类代谢途径（对象）
那么：你手头是有这个苷类代谢的 异常表型（突变）株么？ 还是 通过某种刺激可以实现 明显改变这个苷类代谢途径？
如果都没有，仅仅是有这个植物……那么直接测个转录组|蛋白组，甚至基因组，对研究某个很具体的途径来说，都不会有多么好的提示作用。
大体意思其实就是：得有个对照组+实验组的组合
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5楼2012-11-23 08:56:11
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