24小时热门版块排行榜    

查看: 4387  |  回复: 19
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zxd95

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 植物转录组测序 已有14人参与

最近设计实验,想弄清龙胆苷类代谢途径,首先想到了转录组测序,找代谢相关基因。龙胆的基因组还没有测序,测序后是无参照的。进行转录组测序有什么要求,需要注意哪些问题?可以选用拟南芥做参照进行功能注释吗?希望做过转录组的同志们指点指点,谢谢!
回复此楼
追梦的人
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cxfy61910

铁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by zxd95 at 2012-12-09 17:45:04
对照:龙胆的叶片;
实验组:龙胆的根
苷类代谢在根中合成和累积,在叶中则很少或没有...

我觉得你这样的设计有点问题,叶片和根中本来就有很多特异表达的基因,这两者转录组测序后比对出的差异基因很大一部分应该跟你研究的无关。我认为既然苷类是在根中合成和积累,那就应该测根的。对照为正常龙胆根,实验组是经过处理过的龙胆根(具体处理查一下文献吧,我也不清楚)
11楼2013-03-08 11:13:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

atlanticwi

金虫 (正式写手)

琴美喜欢发呆 不喜欢发脾气


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
嗯.............
       木做过,帮顶,挺感兴趣的,希望有高手指点
Let God do with it as He wills
2楼2012-10-05 11:25:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

crab922

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
没有高手回复呀,我也很想学习这个。
3楼2012-11-22 21:46:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

德国工兵铲

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
想学习这方面知识,期待高人出现
4楼2012-11-22 23:03:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:37 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:01 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 4/200 2026-08-30 18:51 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:50 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:07 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +7 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 18:07 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 17:03 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 14:03 by GkCVyODlx4mR
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +6 德尚中行 2026-08-27 7/350 2026-08-30 12:53 by Bxndjjd
[博后之家] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:19 by l0VvVHGBGRLv
[考博] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-30 11:10 by l0VvVHGBGRLv
[教师之家] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 8/400 2026-08-30 05:48 by ZPa0EcMwuECS
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +9 苏东坡二世 2026-08-23 9/450 2026-08-29 14:41 by hustersqt
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
信息提示
请填处理意见