应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » 求助用siesta计算COHP
51/1返回列表
查看: 3098  |  回复: 16
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

星愿9997

银虫 (小有名气)

[求助] 求助用siesta计算COHP

因为我一直用vasp计算的，只是想用siesta补算COHP性质，所以对siesta这个软件不太了解，诚恳希望大家能够帮忙！
我现在设置基本按照例子中的基本设置设的，COHP是用siesta算完再用mprop这个程序算的。可做出的COHP图和用vasp做的DOS图差太多，根本对不上。。想问问是什么原因。我的输入文件是否有问题。
我的输入文件fdf是：
SystemName       I4/mcm K3ZnH5 GGA   # Descriptive name of the system
SystemLabel            K3ZnH5

# Species and atoms

NumberOfSpecies        3      
NumberOfAtoms          36      
%block ChemicalSpeciesLabel
    1    1  H
    2   19  K
    3   30  Zn
%endblock ChemicalSpeciesLabel

COOP.Write T
#WFS.EnergyMax 10.0 eV
####Diag.ParallelOverK T

# Basis

PAO.EnergyShift        0.137 eV
PAO.BasisSize          DZP
#PAO.BasisType          split
#PAO.SplitNorm         0.150000

LatticeConstant       1.0 Ang  

%block LatticeVectors         
7.612020   0.000000   0.000000
0.000000   7.612020   0.000000
0.000000   0.000000  11.213250
%endblock LatticeVectors

MeshCutoff          100.000000 Ry

xc.functional         GGA           # Exchange-correlation functional
xc.authors            PBE           # Exchange-correlation version

SpinPolarized         False          # Logical parameters are: yes or no

MeshCutoff           150. Ry        # Mesh cutoff. real space mesh

# SCF options
MaxSCFIterations       40           # Maximum number of SCF iter
DM.MixingWeight       0.1           # New DM amount for next SCF cycle
DM.Tolerance          1.d-3         # Tolerance in maximum difference
                                    # between input and output DM
DM.UseSaveDM          true          # to use continuation files
DM.NumberBroyden        3           # Broyden mixing

SolutionMethod        diagon        # OrderN or Diagon
#ElectronicTemperature  25meV       # Temp. for Fermi smearing

# MD options

MD.TypeOfRun           cg           # Type of dynamics:
MD.NumCGsteps           0           # Number of CG steps for

AtomicCoordinatesFormat     Fractional   
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
  0.1242926376500364  0.6242926376500364  0.1617964752489627  1
  0.8757073623499636  0.3757073623499636  0.1617964752489627  1
  0.3757073623499636  0.1242926376500364  0.1617964752489627  1
  0.8757073623499636  0.6242926376500364  0.6617964752489627  1
  0.6242926376500364  0.8757073623499636  0.1617964752489627  1
  0.8757073623499636  0.6242926376500364  0.3382035247510373  1
  0.1242926376500364  0.3757073623499636  0.3382035247510373  1
  0.6242926376500364  0.1242926376500364  0.3382035247510373  1
  0.3757073623499636  0.8757073623499636  0.3382035247510373  1
  0.8757073623499636  0.3757073623499636  0.8382035247510373  1
  0.1242926376500364  0.6242926376500364  0.8382035247510373  1
  0.6242926376500364  0.8757073623499636  0.8382035247510373  1
  0.3757073623499636  0.1242926376500364  0.8382035247510373  1
  0.1242926376500364  0.3757073623499636  0.6617964752489627  1
  0.3757073623499636  0.8757073623499636  0.6617964752489627  1
  0.6242926376500364  0.1242926376500364  0.6617964752489627  1
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.0000000000000000  1
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.5000000000000000  1
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.5000000000000000  1
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.0000000000000000  1
  0.6809470143038610  0.1809470143038610  0.0000000000000000  2
  0.3190529856961390  0.8190529856961390  0.0000000000000000  2
  0.8190529856961390  0.6809470143038610  0.0000000000000000  2
  0.1809470143038610  0.3190529856961390  0.0000000000000000  2
  0.6809470143038610  0.8190529856961390  0.5000000000000000  2
  0.3190529856961390  0.1809470143038610  0.5000000000000000  2
  0.1809470143038610  0.6809470143038610  0.5000000000000000  2
  0.8190529856961390  0.3190529856961390  0.5000000000000000  2
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.2500000000000000  2
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.7500000000000000  2
  0.0000000000000000  0.0000000000000000  0.7500000000000000  2
  0.5000000000000000  0.5000000000000000  0.2500000000000000  2
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.2500000000000000  3
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.2500000000000000  3
  0.0000000000000000  0.5000000000000000  0.7500000000000000  3
  0.5000000000000000  0.0000000000000000  0.7500000000000000  3
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
下面是用siesta做的COHP和vasp做的DOS图。

COHP



DOS
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

材料相关（第一性vasp等）

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-09-11 14:59:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星愿9997

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hakuna at 2012-09-12 10:04:59
没用过siesta，既然既然能做COHP，一定是原子轨道做基，而VASP是平面波，有差异很正常，主要是能量位置对不上......
建议你DOS也拿SIESTA做，这样就应该对上了

主要是我文章都是用vasp做的，是审稿人让我补算cohp。我还是想用我原来的数据呢
赞一下 回复此楼
6楼2012-09-12 10:43:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答

xyzzz986

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-09-13 10:25:01
能量0点是否对齐了?
赞一下 回复此楼
2楼2012-09-11 15:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星愿9997

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xyzzz986 at 2012-09-11 15:34:46
能量0点是否对齐了?

额，可能没有。。怎么设置对齐呢？
赞一下 回复此楼
3楼2012-09-11 15:45:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

星愿9997

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xyzzz986 at 2012-09-11 15:34:46
能量0点是否对齐了?

还想问一下，我的输入文件其他设置可以吗？
赞一下 回复此楼
4楼2012-09-11 15:51:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 17 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的，真有人买论文么？感觉没必要啊 +11 Tide man 2026-08-10 12/600 2026-08-15 02:12 by home3163
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 01:40 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 5/250 2026-08-15 00:52 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 HFw0lei2R37i 2026-08-14 8/400 2026-08-15 00:16 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] filecode +6 cratir 2026-08-14 10/500 2026-08-14 18:29 by 笑叹辞穷
[基金申请] 奇怪，两个人的filecode固定段从头到尾一模一样 +8 布布和一二 2026-08-10 11/550 2026-08-14 14:58 by Equinoxhua
[基金申请] 有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验） +6 majunge000 2026-08-11 8/400 2026-08-14 14:44 by 医学老男孩
[基金申请] FileCode能看出啥？ +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] Filecode 又变了，巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能，周易传统文化，filecode打分制来了，3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见，大家看看几个A，几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分？ +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果，有咨询渠道？？？ +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 2026国自然放榜时间 +9 布布和一二 2026-08-08 9/450 2026-08-10 11:22 by xxxx2020
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] 关于filecode，很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭