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铁虫 (小有名气)

[求助] 如何在一个晶胞的中间位置加入一个小分子水分子？最好是中间位置

Sample Text
如题，想在一个10*10*10的盒子中加入一个小分子，比如水分子，
1、怎样才可以刚好放到中间位置呢？我想进一步用DMOL3 来计算它的热力学性质，位置的不一样还有影响么？
2、我用MS画的水分子的结构式，这个肯定不是标准的H2O分子结构,是不是最好优化之后再加入到晶胞里面呢？
很糊涂，不知道该怎么办 ，求各位大侠出手帮助，在此先谢过了
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day day up!!!
1楼 2012-08-21 20:31:47
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金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-08-22 09:08:07
1.格子大小确定后，中心的坐标就可以计算出来。先在格子里画个氧原子，properties里面可以修改O的坐标，把中心坐标填上，补上H。位置不一样没有影响。
2. 优化放进去，还是放进去再优化，也没影响。就这么一个水分子的体系，试着算一下比较一下角度键长电荷分布啥的，几分钟就清楚了。学习的过程嘛
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2楼2012-08-21 22:52:53
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