24小时热门版块排行榜    

查看: 3750  |  回复: 13

beanundersky

木虫 (小有名气)

[求助] 关于3个水分子的粗粒化

本人是DPD新手,看到很多文献中写着将3个水分子划分为1个珠子,不知道具体如何操作,能将3个水分子划分为一个珠子,哪位虫友能够指点下~多谢
回复此楼
化朽为奇,工石为玉
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2012-03-02 07:13:53
beanundersky(金币+1): 有帮助 2012-03-02 10:11:46
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/cgtools/
的最后是四个水分子构成一个珠子

你参考以下修改为3个水分子构成一个珠子
2楼2012-03-01 13:46:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beanundersky

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-03-01 13:46:41:
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/cgtools/
的最后是四个水分子构成一个珠子

你参考以下修改为3个水分子构成一个珠子

我是在MS软件里建模...VMD建模后导入吗?还是在MS软件里有其他方法
化朽为奇,工石为玉
3楼2012-03-01 15:47:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2012-03-02 07:14:07
beanundersky(金币+1): 有帮助 2012-03-02 10:13:12
没有细节问题,如果真想弄清楚为什么DPD的一个粒子对应3个水分子,可以看看Groot在1997年JCP文章(107-4423),但实际上DPD 对应几个水分子,是你说了算的,看你的要求了。
4楼2012-03-02 01:20:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
beanundersky(金币+1): 有帮助 2012-03-02 10:13:04
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-03-20 18:24:32
建议去查一下这个:

Professor Arun Yethiraj, Department of Chemistry, University of Wisconsin - Madison

http://yethiraj.chem.wisc.edu

记得他提了一个BMW模型, 关于水的DPD.
Life, Love, Laugh.
5楼2012-03-02 09:15:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

B4-449

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-03-20 18:24:37
这是人为规定的,主要是为了各类别珠子体积相似。你的体系要先定一个标准,设置各珠子的大概尺寸,例如1nm3, 这样的话所有珠子的体系都接近1nm3。
6楼2012-03-20 17:01:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

不知道LZ还在关心这个吗? 最近刚好要准备上课的东西, 又在弄DPD, 有机会一起讨论.
Life, Love, Laugh.
7楼2012-03-22 10:27:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beanundersky

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by qphll at 2012-03-22 10:27:56:
不知道LZ还在关心这个吗? 最近刚好要准备上课的东西, 又在弄DPD, 有机会一起讨论.

讨论不敢说,要向您学习~~
化朽为奇,工石为玉
8楼2012-03-22 21:24:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

B4-449

铁杆木虫 (著名写手)

这是设置体积大小时自定的,没啥特殊的方法和原则。
9楼2012-05-28 14:20:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beanundersky

木虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by B4-449 at 2012-05-28 14:20:37
这是设置体积大小时自定的,没啥特殊的方法和原则。

那三个水为一个珠子的溶解度参数和一个水为一个珠子的溶解度参数一致?
化朽为奇,工石为玉
10楼2012-05-29 09:21:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 beanundersky 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +6 一鸭鸭哟 2026-03-14 7/350 2026-03-15 22:12 by Winj1e
[文学芳草园] 伙伴们,祝我生日快乐吧 +15 myrtle 2026-03-10 24/1200 2026-03-15 21:16 by 苏州_逗号
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 0703化学调剂 ,六级已过,有科研经历 +4 曦熙兮 2026-03-15 4/200 2026-03-15 18:01 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 化学工程321分求调剂(南京工业,浙江工业) +3 大米饭! 2026-03-09 4/200 2026-03-14 02:34 by JourneyLucky
[考研] 295复试调剂 +5 简木ChuFront 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:29 by JourneyLucky
[考研] 308求调剂 +5 是Lupa啊 2026-03-11 5/250 2026-03-13 22:13 by JourneyLucky
[考研] 333求调剂 +3 球球古力 2026-03-11 3/150 2026-03-13 21:27 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考研] 333求调剂 +3 152697 2026-03-12 4/200 2026-03-13 07:08 by Iveryant
[考研] 哈工大材料324求调剂 +6 闫旭东 2026-03-10 8/400 2026-03-10 22:49 by 星空星月
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
信息提示
请填处理意见