24小时热门版块排行榜    

查看: 3600  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

beanundersky

木虫 (小有名气)

[求助] 关于3个水分子的粗粒化

本人是DPD新手,看到很多文献中写着将3个水分子划分为1个珠子,不知道具体如何操作,能将3个水分子划分为一个珠子,哪位虫友能够指点下~多谢
回复此楼
化朽为奇,工石为玉
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beanundersky

木虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-03-01 13:46:41:
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/cgtools/
的最后是四个水分子构成一个珠子

你参考以下修改为3个水分子构成一个珠子

我是在MS软件里建模...VMD建模后导入吗?还是在MS软件里有其他方法
化朽为奇,工石为玉
3楼2012-03-01 15:47:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs(金币+4): 谢谢 2012-03-02 07:13:53
beanundersky(金币+1): 有帮助 2012-03-02 10:11:46
http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/cgtools/
的最后是四个水分子构成一个珠子

你参考以下修改为3个水分子构成一个珠子
2楼2012-03-01 13:46:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2012-03-02 07:14:07
beanundersky(金币+1): 有帮助 2012-03-02 10:13:12
没有细节问题,如果真想弄清楚为什么DPD的一个粒子对应3个水分子,可以看看Groot在1997年JCP文章(107-4423),但实际上DPD 对应几个水分子,是你说了算的,看你的要求了。
4楼2012-03-02 01:20:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qphll

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
beanundersky(金币+1): 有帮助 2012-03-02 10:13:04
zh1987hs: 金币+3, 谢谢 2012-03-20 18:24:32
建议去查一下这个:

Professor Arun Yethiraj, Department of Chemistry, University of Wisconsin - Madison

http://yethiraj.chem.wisc.edu

记得他提了一个BMW模型, 关于水的DPD.
Life, Love, Laugh.
5楼2012-03-02 09:15:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见