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banlangeny

银虫 (小有名气)

[求助] 求助 磁珠接DNA以及其吸附问题!!!!!!!!!

在修饰了-COOH的磁珠上连接NH3修饰的DNA(29碱基),再将罗丹明修饰的DNA(14个碱基)杂交在上述DNA上。
    具体操作为:取100 ul 磁珠,用200 ul 的咪唑盐酸(ph=6.8)清洗三次,磁分离后,用咪唑盐酸还原为100ul体系,再加入400 ul EDC(0.1M,现配现用)超声1min后活化1h,磁分离后加入200 ul TAE(ph=8.0) buffer。取10 ul 0.00001M 用NH3修饰的DNA加入10 ul 咪唑盐酸(ph=6.8)混合30min后加入到用TAE稀释的磁珠中,在摇床中震荡下,37度,反应12h。磁分离,用200 ul PBS(ph=9.0)的清洗三次,加入200 ul TAE(ph=8.0) buffer,再加入10 ul 0.00001M 罗丹明修饰的DNA,在37度下杂交2 h。磁分离,用200 ul PBS(ph=9.0)的清洗7次,将最后四次清洗液混合在分光光度计上测荧光,磁珠用TAE稀释后去激光共聚焦上拍照。
   结果:1,在激光共聚焦上拍的照片显示,有的时候接的非常均匀,荧光可以在单个磁珠上显示,但多数的实验荧光是在磁珠聚集团的上面显示,单个磁珠不能显示荧光
           2,最后四次的混合液测荧光发现还是有信号,说明前三次清洗不干净
  问题:1,如何清洗磁珠,使磁珠对DNA的吸附降到最低。
           2,磁珠接DNA,如何使DNA能够尽量多的并且均匀的连接在磁珠上。
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lina_2011

金虫 (小有名气)

我最近在做这个实验,对您的帖子很感兴趣。请问你实验里面用到的咪唑盐酸是用什么配的呢?EDC是脱水剂,那这样的话还可以用水做溶液吗?谢谢
9楼2013-11-03 11:30:46
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luzhuoxuan

捐助贵宾 (小有名气)


【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
banlangeny: 金币+1 2012-08-21 08:57:36
1 要均匀的话,在摇床中震动是否合适,一般选择恒温振荡器,即便如此大概每半个小时,要到涡旋仪上强涡旋1分钟。再试试看时间,觉得正常情况下无需12个小时那么长,可以参考下英骏它们试剂盒的一些操作方式。
2 降低背景,可以用杂交温度稍微提高一点,或者杂交时间减少一些,也可以更换一下洗涤液的配方。
3楼2012-08-20 21:15:43
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banlangeny

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by caizeyuan922 at 2012-08-20 21:46:02

5楼2012-08-21 08:58:17
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stavexiao

银虫 (小有名气)

请问你的磁珠是自己做的 还是买的?如果是买的请问从哪个公司买的?
6楼2012-08-21 10:15:09
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