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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】求吸附能，吸附热的问题
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hukd

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求吸附能，吸附热的问题

我用sorption做丁烷吸附在MFI的模拟。想求吸附热。我看了文献和论坛上交流去做但结果不对。下面是我做的过程：

1.   import 丁烷，用 discover 优化，并记下优化好的能量 -5.52kcal/mol

2.  import MFI,  做 P1,  用discover 优化，并记下优化好的能量-5697.72 （单位它没写清楚但我推测一般discover能量是用kcal/mol）

3.  用sorption 做fixed locating, loading 分子数为1, 温度 300K， 力场 PCFF，其他基本按默认值，平衡500000步，产出也用了 500000步。

4.  吸附完后，我把轨迹文件中的lowest energy的3D 文件打开，并用discover计算了能量（我没有再对其优化），得到能量为-1949.51kcal/mol

5. 根据吸附能=吸附质能量+吸附体能量-吸附复合体能量
=-5.52 kcal/mol+（-5697.72 kcal/mol ）- （-1949.51 kcal/mol） =3753.73kcal/mol ， 和文献中实验以及其他模拟的值（50 kj/mol） 相差十万八千里，

所以想请教一下大家。
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1楼 2011-03-28 11:06:23
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hukd

银虫 (小有名气)
没有人知道吗？ 请高手现身
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2楼2011-03-28 16:20:54
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zxrhuanan

金虫 (著名写手)
★ ★
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franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-06-06 21:02:17
你这样子算差的肯定很远，看out文件
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3楼2011-06-06 20:39:12
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kmw.8668

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
是不是计算所用的软件不一样？
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4楼2011-06-07 10:29:20
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charityqi

木虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-06-22 10:04:19
你是要算化学吸附吗？印象里adsorption得到的物理吸附的，所以分子距离离得都很远
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5楼2011-06-21 22:10:26
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qi-cheng

铜虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by hukd at 2011-03-28 11:06:23:
我用sorption做丁烷吸附在MFI的模拟。想求吸附热。我看了文献和论坛上交流去做但结果不对。下面是我做的过程：

1.   import 丁烷，用 discover 优化，并记下优化好的能量 -5.52kcal/mol

2.  import MFI,  做 ...

我想请教一下，怎么把实验值和用MS得到的计算值进行对比？
比如说用DMOL一般是算一个分子在一个面上的吸附，而实验一般是一定量的气体在一定量的吸附剂上的吸附，这样两个得到的结果有可比性吗？我不知道怎么把实验和计算结合起来，请教。。。
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6楼2011-09-08 13:58:20
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026li

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
15433楼: Originally posted by hukd at 2011-03-28 11:06:23
我用sorption做丁烷吸附在MFI的模拟。想求吸附热。我看了文献和论坛上交流去做但结果不对。下面是我做的过程：

1.   import 丁烷，用 discover 优化，并记下优化好的能量 -5.52kcal/mol

2.  import MFI,  做  ...

你想得到吸附能，用量化的方法计算更精确，主要是化学吸附，也可能得到物理吸附，比如形成氢键的弱相互作用。你用MS作的是物理吸附，这和实验文献会差很多
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7楼2012-11-30 15:04:53
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