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hukd

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助】求吸附能,吸附热的问题

我用sorption做丁烷吸附在MFI的模拟。想求吸附热。我看了文献和论坛上交流去做但结果不对。下面是我做的过程:

1.   import 丁烷,用 discover 优化,并记下优化好的能量 -5.52kcal/mol

2.  import MFI,  做 P1,  用discover 优化,并记下优化好的能量-5697.72 (单位它没写清楚但我推测一般discover能量是用kcal/mol)

3.  用sorption 做fixed locating, loading 分子数为1, 温度 300K, 力场 PCFF,其他基本按默认值,平衡500000步,产出也用了 500000步。

4.  吸附完后,我把轨迹文件中的lowest energy的3D 文件打开,并用discover计算了能量(我没有再对其优化),得到能量为-1949.51kcal/mol

5. 根据吸附能=吸附质能量+吸附体能量-吸附复合体能量
=-5.52 kcal/mol+(-5697.72 kcal/mol )- (-1949.51 kcal/mol) =3753.73kcal/mol , 和文献中实验以及其他模拟的值(50 kj/mol) 相差十万八千里,

所以想请教一下大家。
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hukd

银虫 (小有名气)


没有人知道吗? 请高手现身
2楼2011-03-28 16:20:54
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zxrhuanan

金虫 (著名写手)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-06-06 21:02:17
你这样子算差的肯定很远,看out文件
3楼2011-06-06 20:39:12
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kmw.8668

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
是不是计算所用的软件不一样?
4楼2011-06-07 10:29:20
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charityqi

木虫 (小有名气)


★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zzy870720z(金币+1): 鼓励交流 2011-06-22 10:04:19
你是要算化学吸附吗?印象里adsorption得到的物理吸附的,所以分子距离离得都很远
5楼2011-06-21 22:10:26
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qi-cheng

铜虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by hukd at 2011-03-28 11:06:23:
我用sorption做丁烷吸附在MFI的模拟。想求吸附热。我看了文献和论坛上交流去做但结果不对。下面是我做的过程:

1.   import 丁烷,用 discover 优化,并记下优化好的能量 -5.52kcal/mol

2.  import MFI,  做 ...

我想请教一下,怎么把实验值和用MS得到的计算值进行对比?
比如说用DMOL一般是算一个分子在一个面上的吸附,而实验一般是一定量的气体在一定量的吸附剂上的吸附,这样两个得到的结果有可比性吗?我不知道怎么把实验和计算结合起来,请教。。。
6楼2011-09-08 13:58:20
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026li

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
15433楼: Originally posted by hukd at 2011-03-28 11:06:23
我用sorption做丁烷吸附在MFI的模拟。想求吸附热。我看了文献和论坛上交流去做但结果不对。下面是我做的过程:

1.   import 丁烷,用 discover 优化,并记下优化好的能量 -5.52kcal/mol

2.  import MFI,  做  ...

你想得到吸附能,用量化的方法计算更精确,主要是化学吸附,也可能得到物理吸附,比如形成氢键的弱相互作用。你用MS作的是物理吸附,这和实验文献会差很多
7楼2012-11-30 15:04:53
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