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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助成功】MS模拟沸石的吸附性能时的一些问题
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助成功】MS模拟沸石的吸附性能时的一些问题已有6人参与

自己接触MS的时间不是很长，在最近老板要我用MS来模拟5A分子筛对CO2、H2O的吸附性能。在做的时候基本上是照着文献以及MS的帮助来做的，但是效果不理想，主要感觉就是对于MS的模块里的一些东西很不熟悉，所以来向大家请教一下，主要是：
1.在MS中给的沸石的结构并没有现成的5A的结构，只有LTA的结构，而LTA结构里是没有CA2+和NA+的，对于如何将离子加到LTA中，MS的help里举的ZSM-5里添加离子的离子是用sorption模块里的locate，力场用的是CVFF，我在做的时候也是用这种方法，但是得到的结果中Ca2+在LTA中的位置与文献中给出的不一致，其中的原因是什么，希望有经验的高手能给予帮助
2.在模拟过程中，计算能量时会用要选取力场，在MS中提供有多种力场，但是在文献中给出的力场参数都是修改过的，而且不同的文献给出的值（主要是ε和σ）又通常不同，所以我在做的时候就感觉很迷茫，不知道该用哪个，如果都尝试的话又太费时间，不知道在参数的选取上是不是有什么技巧或者有什么经验的方法？希望有这方面知识的能分享一下
3.在模拟中需要对其中的各种元素赋予电荷，在赋电荷的时候我现在所知道的方法是有两种，一是利用高斯或DMOL计算，这里涉及切簇，在这方面不是很懂。另一种是参考文献的数据，但是同力场参数一样，不同文献给出的电荷相差也很大。所以想请教一些在电荷上是怎么弄比较好。

[ Last edited by shiyiwenren on 2010-9-13 at 10:48 ]
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1楼2010-06-24 16:09:56
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zyj8119

木虫 (著名写手)
支持一下。。。
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好好学习，天天向上。
2楼2010-06-24 18:00:26
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冬凌草8398

金虫 (正式写手)

博士
★ ★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-06 23:08:18
shiyiwenren(金币+2): 2010-07-07 08:18:04
hometownlove(金币+1):谢谢交流 2010-07-07 12:24:45
LOCATE是基于模拟退火方法来获得阳离子的最佳位点，其与实验测得的位置是有区别的。或者是和实验得到不一样。
力场的话多看别人文献，自己很难获得尤其是我们这些初学者。尽量先应用别人的计算结果。
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勇于发现化学世界的美！
3楼2010-07-06 20:38:50
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cmwangdft

木虫 (小有名气)
★
lvjian8596(金币+1):感谢交流！ 2010-07-06 23:08:28
shiyiwenren(金币+1): 2010-07-07 08:18:11
牛的话可以尝试DL_POLY
里面可以自己修改
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妙不可言
4楼2010-07-06 21:36:04
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zyj8119

木虫 (著名写手)
★
hometownlove(金币+1):谢谢交流 2010-07-07 12:24:30
DL_POLY?那个用起来比较难，初学者很难。。
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好好学习，天天向上。
5楼2010-07-07 10:01:20
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 冬凌草8398 at 2010-07-06 20:38:50:
LOCATE是基于模拟退火方法来获得阳离子的最佳位点，其与实验测得的位置是有区别的。或者是和实验得到不一样。
力场的话多看别人文献，自己很难获得尤其是我们这些初学者。尽量先应用别人的计算结果。

我想请教一下，在用MS退火方法模拟阳离子的最佳位置的时候，对于其中的尝试和生成步数以及退火时的温度循环的设置上有什么具体的要求没，是不是步数越多越好，温度循环次数越多越好？我在用退火方法模拟Ca2+和Na+在LTA分子筛中的位置的时候发现对于相同的温度循环次数（比如我设了50）下，有些步数是可以的，而有些就不行，结果会显示用于循环的步数太少。
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6楼2010-07-12 16:19:28
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冬凌草8398

金虫 (正式写手)

博士
★
shiyiwenren(金币+1): 2010-07-12 22:20:35
hedaors(金币+1):谢谢回复 2010-07-12 23:00:13
一般在超精下计算就可以了，设置太长的话也没有太大意思，其实你在做吸附过程中区别不是很大。但前提是一定要所有的构型计算参数要统一。
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勇于发现化学世界的美！
7楼2010-07-12 21:33:50
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shiyiwenren

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 冬凌草8398 at 2010-07-12 21:33:50:
一般在超精下计算就可以了，设置太长的话也没有太大意思，其实你在做吸附过程中区别不是很大。但前提是一定要所有的构型计算参数要统一。

问一下，什么是超精计算啊？你指的构型参数统一是指那些参数啊？另外我在设置不同的步数得到的构型都不一样，而且都不是我要的构型，所以我才用不同的步数来尝试的
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8楼2010-07-12 22:29:53
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红薇染露

银虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送红花一朵
同样的问题，请楼主指教
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9楼2014-02-20 14:34:37
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Vampirekend

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
请问楼主已经解决了吗？我也是初学者，对这些也是云里雾里。。。在用sorption进行GCMC需要设置各个原子电荷吗？如果需要又通过怎样的计算得到？谢谢不吝赐教！
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10楼2017-03-25 10:49:02
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