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fengyunqb

新虫 (小有名气)

[求助] 上下游引物格式问题。

最近设计引物,我有个疑问。希望有经验的虫子指点下。我是多序列比对保守区设计简并引物。我想问下上下游引物的格式:上游引物是从5‘到3’端跟保守区相同。而下游引物是从3‘到5’端跟保守区互补。保守区都从5‘到3’排。对吗?我从PRIMER上观察是这样的。还有如果我设计两对简并引物会不会产物比较混乱。设计一对好还是两对好。谢谢解答。
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dshlove

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-08-17 14:08:53
amisking: 回帖置顶 2012-08-17 21:35:28
fengyunqb: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢你的帮助。 2012-08-18 11:01:30
fengyunqb: 金币+7, ★★★★★最佳答案 2012-08-24 15:25:40
都是只表示成5‘到3’排列。
上游引物是从5‘到3’端跟保守区相同,下游就直接是跟保守区反向互补。
因为引物是相当于一条链的延伸的排头兵,所以,只要设计一对引物就行了。注意区分好上下游就行了。
2楼2012-08-17 13:28:59
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fengyunqb: 金币+3, 有帮助, 谢谢你的信息。 2012-08-18 11:01:47
我同学做的时候设计了2对引物,做的巢式pcr
3楼2012-08-17 17:37:27
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