应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 计算反应路径应该猜测出过渡态然后用IRC么
91/1返回列表
查看: 1195  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

t13340033021

金虫 (正式写手)

[求助] 计算反应路径应该猜测出过渡态然后用IRC么

最近小虫在做一个笼状化合物，已经优化了某个分子在笼中的结构。想知道笼中分子跃出笼的能垒是多少
    请教各位用IRC还需要知道该笼内分子跃出笼路径的势能马鞍面，如果是，又如何寻找呢？

[ 来自科研家族 神龙鱼族馆 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
甲烷无敌
1楼 2012-08-15 23:48:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如这样还不如做个scan看能垒呢
赞一下 回复此楼
2楼2012-08-16 10:05:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

t13340033021

金虫 (正式写手)
如果SCAN的话
笼分子的变化是不是就不能反映出来，还是需要用TS找到那个马鞍点再进行IRC？
赞一下 回复此楼
甲烷无敌
3楼2012-08-16 10:59:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kingleaves

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
t13340033021: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-08-26 16:55:08
用qst2来得到过渡态会比较容易些
赞一下 回复此楼
4楼2012-08-17 23:09:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luojin7653

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

计算过渡态 查看虚频 做irc
赞一下 回复此楼
今晚打老虎
5楼2012-08-19 11:33:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

313588908

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

scan还是很有必要做的，可以发现能量变化趋势。然后找到能量较高的一些点，就可以找TS了。qst2相对就太盲目了。
赞一下 回复此楼
6楼2012-08-21 02:44:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

t13340033021

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 313588908 at 2012-08-21 02:44:44
scan还是很有必要做的，可以发现能量变化趋势。然后找到能量较高的一些点，就可以找TS了。qst2相对就太盲目了。

做SCAN是不是太昂贵了
我的笼还是很柔性的，如果不考虑笼分子的变化只做笼内分子的SCAN也不太能反映问题吧
赞一下 回复此楼
甲烷无敌
7楼2012-08-21 16:50:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

313588908

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
t13340033021: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-08-26 16:56:01
SCAN不昂贵吧，你只做单一坐标的扫描即可。我以前做过环糊精为客体的反应，就是在半径轴上的单一坐标的扫描。
赞一下 回复此楼
8楼2012-08-21 19:14:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

t13340033021

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 313588908 at 2012-08-21 19:14:10
SCAN不昂贵吧，你只做单一坐标的扫描即可。我以前做过环糊精为客体的反应，就是在半径轴上的单一坐标的扫描。

你的是柱体，我的是笼。如果不考虑笼内分子脱离时笼的扩张，由于静电排斥，势垒不是一般的大吧
赞一下 回复此楼
甲烷无敌
9楼2012-08-22 16:44:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 t13340033021 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085600材料与化工 +4 安全上岸！ 2026-03-16 4/200 2026-03-17 14:02 by 勇敢太监王公公
[考研] 290求调剂 +6 @将就将就看 2026-03-10 11/550 2026-03-17 10:22 by @将就将就看
[考研] 化学工程321分求调剂 +10 大米饭！ 2026-03-15 13/650 2026-03-17 06:57 by laoshidan
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 4/200 2026-03-16 20:13 by Wangjingyue
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 311求调剂 +5 26研0 2026-03-15 5/250 2026-03-16 16:21 by a不易
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 290求调剂 +5 孔志浩 2026-03-12 10/500 2026-03-16 09:01 by 余晖&
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 求调剂（材料与化工327） +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 310求调剂 +3 【上上签】 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:16 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 工科调剂 +4 Jiang191123！ 2026-03-11 4/200 2026-03-13 15:15 by Miko19
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 308求调剂 +3 是Lupa啊 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:30 by 求调剂zz
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 420求调剂 +4 莫向外求11 2026-03-10 6/300 2026-03-12 14:41 by ruiyingmiao
[考研] 290求调剂 +3 柯淮然 2026-03-10 8/400 2026-03-11 13:48 by 柯淮然
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭