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t13340033021

金虫 (正式写手)

[求助] 计算反应路径应该猜测出过渡态然后用IRC么

最近小虫在做一个笼状化合物,已经优化了某个分子在笼中的结构。想知道笼中分子跃出笼的能垒是多少
    请教各位用IRC还需要知道该笼内分子跃出笼路径的势能马鞍面,如果是,又如何寻找呢?

[ 来自科研家族 神龙鱼族馆 ]
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甲烷无敌
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313588908

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

scan还是很有必要做的,可以发现能量变化趋势。然后找到能量较高的一些点,就可以找TS了。qst2相对就太盲目了。
6楼2012-08-21 02:44:44
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313588908

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
t13340033021: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2012-08-26 16:56:01
SCAN不昂贵吧,你只做单一坐标的扫描即可。我以前做过环糊精为客体的反应,就是在半径轴上的单一坐标的扫描。
8楼2012-08-21 19:14:10
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