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计算反应路径应该猜测出过渡态然后用IRC么
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计算反应路径应该猜测出过渡态然后用IRC么
最近小虫在做一个笼状化合物,已经优化了某个分子在笼中的结构。想知道笼中分子跃出笼的能垒是多少
请教各位用IRC还需要知道该笼内分子跃出笼路径的势能马鞍面,如果是,又如何寻找呢?
[ 来自科研家族
神龙鱼族馆
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甲烷无敌
1楼
2012-08-15 23:48:39
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t13340033021
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8楼
:
Originally posted by
313588908
at 2012-08-21 19:14:10
SCAN不昂贵吧,你只做单一坐标的扫描即可。我以前做过环糊精为客体的反应,就是在半径轴上的单一坐标的扫描。
你的是柱体,我的是笼。如果不考虑笼内分子脱离时笼的扩张,由于静电排斥,势垒不是一般的大吧
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甲烷无敌
9楼
2012-08-22 16:44:19
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lishijunzong
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感谢参与,应助指数 +1
如这样还不如做个scan看能垒呢
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2楼
2012-08-16 10:05:12
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t13340033021
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如果SCAN的话
笼分子的变化是不是就不能反映出来,还是需要用TS找到那个马鞍点再进行IRC?
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甲烷无敌
3楼
2012-08-16 10:59:47
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kingleaves
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【答案】应助回帖
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★★★★★
最佳答案
2012-08-26 16:55:08
用qst2来得到过渡态会比较容易些
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4楼
2012-08-17 23:09:15
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