| 查看: 282 | 回复: 0 | ||
[求助]
请教，分子模拟中螯合离子怎么处理？
|
|
请教一个问题 分子模拟中是怎么处理离子的 比如镁离子 PDB文件里这样注释 REMARK 620 COORDINATION ANGLES FOR: M RES CSSEQI METAL REMARK 620 MG A 397 MG REMARK 620 N RES CSSEQI ATOM REMARK 620 1 RLT A 398 OAH REMARK 620 2 RLT A 398 OAE 81.2 REMARK 620 3 GLU A 221 OE2 93.1 91.1 REMARK 620 4 ASP A 128 OD2 94.3 174.1 85.3 REMARK 620 5 HOH A 400 O 90.6 97.3 171.3 86.6 REMARK 620 6 GLU A 221 OE1 156.4 94.6 63.6 88.0 113.0 REMARK 620 N 1 2 3 4 5 REMARK 620 我是单独将离子作为一个unit呢 还是和相互作用的氨基酸（比如ASP）合成一个UNIT 呢？ 我按前者计算的，但是离子的位置会跑偏了 失去了和周围几个氨基酸的相互作用.  |
回复此楼» 猜你喜欢
319求调剂
已经有4人回复
-
081700化学工程与技术 一志愿中海洋 323 求调剂学校
已经有15人回复
-
085600，320分求调剂
已经有14人回复
-
085600调剂
已经有3人回复
-
求调剂：085600材料与化工，考材科基，总分319
已经有26人回复
-
0703化学
已经有5人回复
-
085600，专业课化工原理，320分求调剂
已经有8人回复
-
一志愿南农090401，268，求调剂
已经有3人回复
-
材料334求调剂
已经有11人回复
-
323求调剂
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~
请教个关于分子模拟或者说理论计算的问题
已经有10人回复
- 请教GROMACS安装
已经有8人回复
- 做离子液体的分子模拟，用哪个分子模拟的软件好呢？
已经有3人回复
- 钙离子，锌离子的AutoDock
已经有4人回复
- 请教分子力学与分子动力学的区别
已经有14人回复
- Gromacs中加入离子
已经有5人回复
- 分子对接前配体是怎么处理的啊-例如用AD做
已经有14人回复
- 【求助】有没有软件可以做金属离子-螯合物的三维结构
已经有3人回复
- 【求助】关于离子液体体系平衡检测
已经有7人回复
- 【求助】哪个软件比较适合模拟纳米通道中的离子输运现象
已经有16人回复
- 【求助】DL-POLY的error185出现应该怎么处理
已经有6人回复
- 【资源】液相色谱常见问题及处理方法
已经有43人回复
- 【求助】新手请教分子模拟问题
已经有27人回复
点击这里搜索更多相关资源科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
