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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 序列比对，相似性
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huifengnayan

铜虫 (初入文坛)

[求助] 序列比对，相似性

同一个基因，挑克隆子后送了N条序列，想从测序回来的这N条序列找不同的序列，怎样把一样序列去掉。 因为很多条序列，用眼看的话，看的很乱，有没有软件，可以看序列的相似性什么的。
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1楼2012-07-31 10:35:59
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

用clustalw，然后用BioEdit来编辑。
Clustalx是图形版的clustalw，个人感觉编辑功能不给力
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6楼2012-08-06 04:37:53
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lanhai6589

铜虫 (初入文坛)
用DNAMAN软件里的多序列比对应该可以吧。
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2楼2012-08-01 09:03:10
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shjia

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
实验室师兄介绍了一个clustalx-2.1-win，似乎很好用
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3楼2012-08-01 10:53:58
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伤何处

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以用多序列对比软件进行比对，然后确定一样的序列，再删除掉。软件有ClustalX，也可以用Vector NTI 上面也整合有Clustal X，比较方便。
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对也罢，错也罢；正也罢，逆也罢；通途也好，崎岖无妨……但问，吾心坚否？若坚，纵使歧路，以铁心，贯穿而过，亦为大道！不坚，便是坦途，也难登临绝顶，观险峰
4楼2012-08-05 10:51:57
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