24小时热门版块排行榜    

查看: 2407  |  回复: 7

huifengnayan

铜虫 (初入文坛)

[求助] 序列比对,相似性

同一个基因,挑克隆子后送了N条序列,想从测序回来的这N条序列找不同的序列,怎样把一样序列去掉。 因为很多条序列,用眼看的话,看的很乱,有没有软件,可以看序列的相似性什么的。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lanhai6589

铜虫 (初入文坛)

用DNAMAN软件里的多序列比对应该可以吧。
2楼2012-08-01 09:03:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shjia

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
实验室师兄介绍了一个clustalx-2.1-win,似乎很好用
3楼2012-08-01 10:53:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

伤何处

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

可以用多序列对比软件进行比对,然后确定一样的序列,再删除掉。软件有ClustalX,也可以用Vector NTI 上面也整合有Clustal X,比较方便。
对也罢,错也罢;正也罢,逆也罢;通途也好,崎岖无妨……但问,吾心坚否?若坚,纵使歧路,以铁心,贯穿而过,亦为大道!不坚,便是坦途,也难登临绝顶,观险峰
4楼2012-08-05 10:51:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mlanqiang

木虫之王 (文学泰斗)

蓝博士

【答案】应助回帖

clustalx-2.1-win这个软件不错,可以推荐一下。
蓝精灵
5楼2012-08-05 11:37:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

用clustalw,然后用BioEdit来编辑。
Clustalx是图形版的clustalw,个人感觉编辑功能不给力
6楼2012-08-06 04:37:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我个人觉得MEGA5.0很好用,另外你同一个基因挑了N个克隆子测得了N个序列,但这N个序列中只有一头一尾有点点区别吧(测序本身的问题带来的),中间序列都是你那个基因应该是一样的,你这样做的意义何在啊??
生物化学与分子生物学
7楼2012-08-28 16:46:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

137167741

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

我有几点疑问:
第一、这个基因多大;
第二、N是多少?
第三、怎样得到的克隆?T载体?这个基因是怎样获得的?纯粹是由PCR得到的?
第四、单纯就是这么怂克隆测序,意义不大,可能最后测序结果都是一样的。差异也许就是某些碱基的差异,这些差异还有可能是由于测序引起的。
第五、比对可以使用ixie生物软件,多序列比对,如MEGA、Clustal X等
呵呵~~~
总有一天我要修改用户名。
8楼2012-08-28 20:29:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 huifengnayan 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +8 基诺咪客 2026-08-17 11/550 2026-08-18 17:13 by 悠然熊猫
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +50 医学老男孩 2026-08-13 109/5450 2026-08-18 16:56 by 医学老男孩
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +9 yuleib84 2026-08-18 10/500 2026-08-18 16:52 by archvillain
[教师之家] 两姐妹,一个辛辛苦苦30岁工作当大学教师,另一个23岁就工作当开车教练 +3 瞬息宇宙 2026-08-11 7/350 2026-08-18 16:42 by LNP@mRNA
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 8/400 2026-08-18 11:47 by gltch
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +4 Tide man 2026-08-14 5/250 2026-08-18 11:35 by Tide man
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
信息提示
请填处理意见