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wjj1139

新虫 (初入文坛)

[求助] 电泳图怎么全是引物二聚体?求解

求大家给我分析一下,为什么电泳图上全是引物二聚体,而我们的目的条带没有出来,退火温度已经很低了。。
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  • 2012-07-24 16:50:15, 2.74 M

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王礼鹏

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-13 15:08:44
同意楼主的看法,可能是引物设计出现了问题,设计的正反引物就容易形成二聚体,建议用primer premier 5 设计引物,里面可以看到你设计的引物是否形成了二聚体。。。。祝好
4楼2012-08-10 09:39:40
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普通回帖

小小树虫

银虫 (小有名气)

跟我P的结果好像额 同求
2楼2012-08-06 17:27:47
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

请加上阴阳对照确定PCR体系中所有component是没有问题的。如果确定没有问题,那就是你设计的引物又问题。
3楼2012-08-06 18:35:13
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myitcat

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引物和模板没结合,做个温度梯度试一下
5楼2012-08-10 09:42:17
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2010013808

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-08-13 15:08:58
复制的的别人的
1. 从引物自身着手,重新设计引物,这是最根本解决这一问题的办法;
2. 可能模板有问题;
3. 模板浓度过小,适当加大模板量;
4. Taq酶,引物,Mg2+浓度可能过高,可降低它们的浓度;
5. 取你所要加的上下游引物混合后,在100摄氏度下的沸水中煮5分钟,然后迅速拿出至于冰块之上瞬时冷却,这时再加入反应体系当中,引物二聚体就会消失的;
6. 所配MIX中加5%的甘油或者5%的DMSO,可以增强特异性;
7. PCR反应体系的配制在冰上进行,最后加TAq酶,PCR结束后,产物勿放置在室温下过长时间,有人认为室温下有些TAQ酶会将多余的引物合成为二聚体。
8. 增加循环数;
9. 降低退火温度后有条带,则应逐渐提高温度,若提高温度的同时产物量减少,则考虑增加镁离子浓度(根据扩增片断长度而定,片段长则相应镁离子浓度应该高一些);
10. 若降低退火温度,发现还是只有引物二聚体,而且镁离子的浓度在 20-25mmol/l没有区别,则考虑Buffer等试剂没有完全融解、混匀,导致吸取的试剂浓度不对。
11. 以上次的pcr产物作模板二次pcr,可以提高引物与模板的特异性,减少引物二聚体,如果两次时间间隔短的话,可以把原产物稀释100-1000倍,如果间隔较长可以稀释50-100倍
一起加油
6楼2012-08-10 14:31:47
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wansanlian

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

加多下你的模板DNA试下嘛~,我们之前也是碰到过这样的问题
乱花渐欲迷人眼
7楼2012-08-13 14:12:56
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wjj1139

新虫 (初入文坛)

谢谢大家

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
8楼2012-08-16 19:46:42
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

个人觉得是引物的问题,如果退火温度已经很低了。重新设计引物试试吧
9楼2012-08-17 00:08:02
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-08-17 13:46:45
楼主,无法判断哈,因为你没有说明是否有阴阳对照。如果阴阳对照都按照预期扩增,而你的引物扩增不出来,那就应该是引物自身的问题,可以换引物。
10楼2012-08-17 07:31:44
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