| 查看: 446 | 回复: 2 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
AMBER中能量优化和模拟的条件怎么选择呢？
|
|||
| AMBER模拟前的能量优化一般要优化到什么程度可以进行模拟了呢？还有模拟的条件大家是怎么选择的？比如步长，步数什么的？我是新手，一点概念也没有，求指教啊。 |
回复此楼» 猜你喜欢
职称评审没过，求安慰
已经有56人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有5人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于amber动力学模拟中MM/GBSA的问题
已经有7人回复
- 求助下 怎么把优化过程中能量变化图形化出来
已经有11人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- AMBER中qm/mm的问题
已经有5人回复
- 【转帖】GROMACS分析程序讨论，在gromacs中添加Amber力场
已经有8人回复
- 【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗？如何选择？
已经有7人回复
lujunyan1118
金虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1306.9
- 帖子: 73
- 在线: 20.4小时
- 虫号: 871655
- 注册: 2009-10-14
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金币+2 2012-08-27 08:57:41
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金币+2 2012-08-27 08:57:41
|
http://ambermd.org/tutorials/ g跟着这个教程做，做完前几个教程就会有感觉了。另外看看别人文献里的方法部分 不同体系是不太一样的， 没有统一的答案，还是从基础的入手，然后融会贯通 |
3楼2012-08-20 12:35:24
vip_zzc
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 105
- 散金: 107
- 帖子: 87
- 在线: 49小时
- 虫号: 758728
- 注册: 2009-04-27
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
2楼2012-07-18 15:13:59