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AMBER中能量优化和模拟的条件怎么选择呢？
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| AMBER模拟前的能量优化一般要优化到什么程度可以进行模拟了呢？还有模拟的条件大家是怎么选择的？比如步长，步数什么的？我是新手，一点概念也没有，求指教啊。 |
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lujunyan1118
金虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1306.9
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- 虫号: 871655
- 注册: 2009-10-14
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
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chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金币+2 2012-08-27 08:57:41
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金币+2 2012-08-27 08:57:41
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http://ambermd.org/tutorials/ g跟着这个教程做，做完前几个教程就会有感觉了。另外看看别人文献里的方法部分 不同体系是不太一样的， 没有统一的答案，还是从基础的入手，然后融会贯通 |
3楼2012-08-20 12:35:24