| 查看: 449 | 回复: 2 | |||
[求助]
AMBER中能量优化和模拟的条件怎么选择呢?
|
| AMBER模拟前的能量优化一般要优化到什么程度可以进行模拟了呢?还有模拟的条件大家是怎么选择的?比如步长,步数什么的?我是新手,一点概念也没有,求指教啊。 |
» 猜你喜欢
求个博导看看
已经有16人回复
想换工作。大多数高校都是 评职称时 认可5年内在原单位取得的成果吗?
已经有8人回复
上海工程技术大学张培磊教授团队招收博士生
已经有4人回复
上海工程技术大学【激光智能制造】课题组招收硕士
已经有5人回复
求助院士们,这个如何合成呀
已经有4人回复
临港实验室与上科大联培博士招生1名
已经有9人回复
需要合成515-64-0,50g,能接单的留言
已经有4人回复
自荐读博
已经有4人回复
写了一篇“相变储能技术在冷库中应用”的论文,论文内容以实验为主,投什么期刊合适?
已经有6人回复
带资进组求博导收留
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
关于amber动力学模拟中MM/GBSA的问题
已经有7人回复
求助下 怎么把优化过程中能量变化图形化出来
已经有11人回复
分子模拟时间越长越好吗?
已经有44人回复
AMBER中qm/mm的问题
已经有5人回复
【转帖】GROMACS分析程序讨论,在gromacs中添加Amber力场
已经有8人回复
【求助】Gromacs和NAMD比Amber快很多吗?如何选择?
已经有7人回复
vip_zzc
铜虫 (小有名气)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 105
- 散金: 107
- 帖子: 87
- 在线: 49小时
- 虫号: 758728
- 注册: 2009-04-27
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能

2楼2012-07-18 15:13:59
lujunyan1118
金虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1306.9
- 帖子: 73
- 在线: 20.4小时
- 虫号: 871655
- 注册: 2009-10-14
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金币+2 2012-08-27 08:57:41
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金币+2 2012-08-27 08:57:41
|
http://ambermd.org/tutorials/ g跟着这个教程做,做完前几个教程就会有感觉了。另外看看别人文献里的方法部分 不同体系是不太一样的, 没有统一的答案,还是从基础的入手,然后融会贯通 |
3楼2012-08-20 12:35:24







回复此楼