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金虫 (正式写手)

[求助] AMBER中能量优化和模拟的条件怎么选择呢？

AMBER模拟前的能量优化一般要优化到什么程度可以进行模拟了呢？还有模拟的条件大家是怎么选择的？比如步长，步数什么的？我是新手，一点概念也没有，求指教啊。

1楼 2012-07-18 13:57:15

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铜虫 (小有名气)

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
903566945: 金币+1 2012-07-18 15:54:18
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-07-18 18:23:52

最网个搜索个实例看看~
这入门最好的办法。
你说的问题案例上都有的。

路漫漫长其修远兮，吾将上下而求索~

2楼2012-07-18 15:13:59

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金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-21 19:21:05
903566945: 金币+2 2012-08-27 08:57:41

http://ambermd.org/tutorials/
g跟着这个教程做，做完前几个教程就会有感觉了。另外看看别人文献里的方法部分

不同体系是不太一样的，没有统一的答案，还是从基础的入手，然后融会贯通

3楼2012-08-20 12:35:24

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