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新虫 (初入文坛)

[求助] 琼脂糖凝胶电泳的条带问题

PCR产物跑胶结果为什么会呈弥散状,弥散后却还有目的条带(前四个是一种,后四个是另一种)。跑过两次了都差不多。以为是退火温度过低,这次的退火温度从上次的60升到了65。还是如此,我的模板时cDNA我也跑了个胶,是图中第二个Marker后面的,居然没有条带不知道是为什么。还请高手指点啊!感激不尽。
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hsf1995

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by reallpf at 2012-07-17 17:47:35
PCR电泳后条带弥散,一片亮带的原因可能有:
1.模板不纯 2.Buffer不合适 3.退火温度偏低 4.酶量过多 5.dNTP、Mg 2+浓度偏高 6.循环次数过多
对策:
1.纯化模板 2.更换Buffer 3.适当提高退火温度 4.适量用酶 5. ...

CDNA用10%琼脂糖跑胶时,上样量该怎么上呢?此外跑出的胶应不应该有条带呢,我查资料说正常的CDNA条带是弥散的
3楼2018-03-29 14:19:20
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
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rainwander: 金币+5, MicEPI+1, 鼓励新虫交流 2012-07-17 17:51:45
PCR电泳后条带弥散,一片亮带的原因可能有:
1.模板不纯 2.Buffer不合适 3.退火温度偏低 4.酶量过多 5.dNTP、Mg 2+浓度偏高 6.循环次数过多
对策:
1.纯化模板 2.更换Buffer 3.适当提高退火温度 4.适量用酶 5.适当降低dNTP和镁离子的浓度 6.减少循环次数

因为你的模版cDNA根本没有跑出条带,所以个人推测你的模板降解严重。因此建议你重新做出纯的模板,分成几份,常用的4度保存;其它-20度保存。

另外,造成你图中所示的电泳结果还可能是电泳的问题,但这个可能性很小。
不过针对这点建议你跑电泳时常更换电泳液,防止核酸酶,杂DNA污染,另外控制好电泳的电压,不要过大。还有你的PCR产物要放置4度,不要放室温后再跑电泳。要么电泳结束马上电泳,要么冰箱4度保存。
2楼2012-07-17 17:47:35
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