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zhangzhen028

新虫 (初入文坛)

[求助] 微生物降解多环芳烃实验中的诡异现象 已有1人参与

本人最近在做微生物降解多环芳烃荧蒽的实验,菌是自己之前在污染土壤里筛的,把菌加到以荧蒽为唯一碳源的无机盐培养基中,以灭活菌为对照,培养七天后用乙酸乙酯萃取,再用甲醇定容做液相测剩余荧蒽浓度。实验做过好几次了,每次测的结果都是灭活菌组的剩余浓度小于活菌组的,求各种大神或者做过类似实验有过类似经验的大神们帮帮小弟这个忙,不甚感激!!!
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, MicEPI+1, good ,很不多,值得一个epi,多来帮助其他中的哦^_^有专家的潜质^_^ 2012-07-15 16:12:21
zhang8826857: 金币+5, 另外,鼓励鼓励新虫,加油哦 2012-07-15 16:12:40
赞同2楼的观点,但是你的菌都是培养7d,所以这种可能性会减少。另外我认为你应该加一个对照,就是不加菌的培养基同实验组一样过程走完再进液相分析。
个人观点认为:
1.首先要确定你活菌实验组的菌是否有生长,以及灭活菌对照组的菌是否没有生长。
2.活菌实验组的菌生长曲线是否与你之前筛的菌的生长曲线大体一致。
3.萃取过程中能否保证实验组和对照组的效率一致。
4.这点可能性非常小,但在我的实验中出现过,就是你配得培养基是否完全混溶好了再分装的。
个人建议:
1.添加一个我所说的空白对照。
2.完善萃取环节。
3.确定你目前所用的菌是否与之前筛的菌一样,可以从生长曲线入手。这点也可以排除由于菌的生长状况带来的你所说的实验结果。
另外请教你一个问题,用乙酸乙酯萃取后为什么用甲醇定容呢?
3楼2012-07-15 14:00:01
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天鸟

木虫 (正式写手)

我想问你个问题,你在做微生物降解PAH的时候,PAH是不溶性的,很多文献是将有机溶剂溶解PAH后,加入到瓶中,等有机溶剂挥发后,在加入菌液降解。问题是PAH都贴在瓶壁上,微生物不太好利用呀。
快乐生活,我快乐
9楼2012-09-20 15:53:25
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普通回帖

石城之子

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你前面筛的菌是降解菌还是只是耐受菌?如果是耐受菌的话,在你确定你的前处理操作过程是没有误差的情况下,是会有这种情况出现的,即有些耐受菌能够稳定(保持)或延缓降解你的靶标物质。
2b老青年。。。
2楼2012-07-15 11:17:06
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

建议我再补充一点:
在实验中要多做几个平行。
4楼2012-07-15 14:01:24
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zhangzhen028

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by reallpf at 2012-07-15 14:00:01
赞同2楼的观点,但是你的菌都是培养7d,所以这种可能性会减少。另外我认为你应该加一个对照,就是不加菌的培养基同实验组一样过程走完再进液相分析。
个人观点认为:
1.首先要确定你活菌实验组的菌是否有生长,以 ...

谢谢你的建议~你说的空白对照我也做了,空白组没有问题,你说的生长曲线我倒是想尝试一下在不同时间段测一下OD600,看看菌的生长情况。至于你说的萃取过程效率一致这应该不能保证吧,这种实验肯定是有小误差的,但都出现我说的情况应该不会是效率的问题吧,还有培养基配好之后我都超声了很久才开始分装的,应该也不会有太大问题。最后,用甲醇定容是我们这边的液相流动相是甲醇。
5楼2012-07-16 09:48:53
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zhangzhen028

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 石城之子 at 2012-07-15 11:17:06
你前面筛的菌是降解菌还是只是耐受菌?如果是耐受菌的话,在你确定你的前处理操作过程是没有误差的情况下,是会有这种情况出现的,即有些耐受菌能够稳定(保持)或延缓降解你的靶标物质。

应该是降解菌吧,筛菌的时候就是在以多环芳烃为唯一碳源的无机盐培养基平板上长的,后来在预实验中也是可以在这种环境下生长的。
6楼2012-07-16 09:51:20
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangzhen028 at 2012-07-16 09:48:53
谢谢你的建议~你说的空白对照我也做了,空白组没有问题,你说的生长曲线我倒是想尝试一下在不同时间段测一下OD600,看看菌的生长情况。至于你说的萃取过程效率一致这应该不能保证吧,这种实验肯定是有小误差的,但 ...

培养基超声啊?你的菌是厌氧菌?做一下生长曲线会提供一些信息。当然谢谢你的答复。我用液相流动相都用的稀硫酸。
7楼2012-07-16 10:33:04
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anlewo7777

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我认为可能你的检测方法的专一性不强,也就是说,你的检测方法并不能只检测到你的底物,你可以用洗涤的菌体测一下,看有没有信号,如果有,可能菌体里的有些物质也被你当做底物算了。
8楼2012-07-18 12:11:28
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wenxu6699

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 天鸟 at 2012-09-20 15:53:25
我想问你个问题,你在做微生物降解PAH的时候,PAH是不溶性的,很多文献是将有机溶剂溶解PAH后,加入到瓶中,等有机溶剂挥发后,在加入菌液降解。问题是PAH都贴在瓶壁上,微生物不太好利用呀。

请问你这个问题后来怎么解决的?
10楼2013-03-13 10:35:31
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