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s100700677

新虫 (初入文坛)

[交流] PET-32a双酶切无法回收 已有8人参与

用SalI和NotI双酶切和t载体连接的目的片段及pET-32a空载体,发现目的片段能一次性顺利回收回来并且鉴定完全正确,但空载体酶切后不是没有条带(提的质粒已经鉴定,浓度和质量绝对么有问题),要不有带但经回收后鉴定时就消失了!!!!做了有四次了,只有一次有条带但鉴定没有了!剩下的都是回收时没有条带!!!!
      个人分析:
      1,酶没有问题,因为目的条带顺利回收!
      2,胶,缓冲液及试剂盒没有问题,因为目的条带顺利回收!
      3,没有降解问题,因为有没有酶切的载体做对照!且marker跑的很好!
      4,提的质粒没有问题吧?!鉴定过了,三条带非常完整,且亮度足够!
      5,酶切是在37度下进行,试过过夜,5小时,4小时,3小时!体系也试过40ul20ul的等等都优化了,结果都一样!
       这个实验以前做过,同样的实验,只不过最近在重复做,但就遇到这种情况了,遇到鬼了!
      希望各位能帮忙分析一下!不甚感激啊!!!!谢谢!!!!!
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syn1985

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有条带回收后又消失了那就表明你的浓度不够 一次多做几管20ul体系的就可以了 如果pET-32a空载体双酶切下的片段很小建议直接用产物回收盒回收 跑一次琼脂糖还是很浪费的
2楼2012-06-30 15:20:15
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yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我在怀疑你的pET-32a菌株有问题。
你提取的可能不是质粒,是基因组。
3楼2012-07-01 11:32:03
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675250244

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
两种情况:
一、可能在酶切过程中存在污染,第一你用的灭菌水有没有问题?第二在37度酶切时你用封口膜把EP管的口封实了么?因为在这个温度下酶切水浴锅里的水可能会进去,会把质粒降解掉。
二、在酶切后跑电泳有其他杂带么?如果有的 话可能你加的酶的量太多了,这两个酶的特异性如果不太好的 话,在酶量过多的情况下就会把质粒切成小片段,而目的基因不会的原因是质粒是圆形的,比目的基因更好切,
坚持每一天
4楼2012-07-01 12:22:17
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boyx

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
看到你这种 情况我也晕了!
自由之思想,独立之灵魂
5楼2012-07-01 12:42:11
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Marado

金虫 (正式写手)

Dreamer


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我今天也要做跟楼主一模一样的实验.
空载体酶切后不是没有条带——这个很诡异,怎么说就算没切完全或者根本没有切上也该有条带的,可能的原因就是楼主酶切的时候质粒降解了或者被污染了.
要不有带但经回收后鉴定时就消失了——问一下楼主酶切后验证时候电泳条带清晰否,如果不清晰说明浓度太低,胶回收本来就有损失,不同试剂盒损失量不同,如果清晰的话,那就说明胶回收操作或者试剂盒有问题.
楼主逐一排除吧,祝楼主好运.
Look,ifyouhadoneshot,oroneopportunity,toseizeeverythingyoueverwanted,inonemoment.Wouldyoucaptureit,orjustletitslip?
6楼2012-07-02 15:13:09
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
1:确定你的质粒pet是否正确?
2:酶切体系的问题,你说 “空载体酶切后不是没有条带(提的质粒已经鉴定,浓度和质量绝对么有问题),要不有带但经回收后鉴定时就消失了!!!!
如果酶切体系不合适,质粒太少,体系太大,点样量过少,根本不会有条带!
还有一种,有条带,回收后就没有条带了,那肯定是纯化/回收过程有问题,将质粒损失掉了!

个人建议,供参考!
祝好运!
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
7楼2012-07-02 19:24:46
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小当佳

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主问题解决了吗?我也遇到了同样的问题,酶切后跑胶条带则挺亮的。但是一回收测浓度就特别低,纯度也不好,同时胶回收别的就可以,只有pET32a不行

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8楼2020-10-02 11:30:31
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junjieshao

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

9楼2020-10-03 00:43:47
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