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s100700677

新虫 (初入文坛)

[交流] PET-32a双酶切无法回收已有8人参与

用SalI和NotI双酶切和t载体连接的目的片段及pET-32a空载体,发现目的片段能一次性顺利回收回来并且鉴定完全正确,但空载体酶切后不是没有条带(提的质粒已经鉴定,浓度和质量绝对么有问题),要不有带但经回收后鉴定时就消失了!!!!做了有四次了,只有一次有条带但鉴定没有了!剩下的都是回收时没有条带!!!!
      个人分析:
      1,酶没有问题,因为目的条带顺利回收!
      2,胶,缓冲液及试剂盒没有问题,因为目的条带顺利回收!
      3,没有降解问题,因为有没有酶切的载体做对照!且marker跑的很好!
      4,提的质粒没有问题吧?!鉴定过了,三条带非常完整,且亮度足够!
      5,酶切是在37度下进行,试过过夜,5小时,4小时,3小时!体系也试过40ul20ul的等等都优化了,结果都一样!
       这个实验以前做过,同样的实验,只不过最近在重复做,但就遇到这种情况了,遇到鬼了!
      希望各位能帮忙分析一下!不甚感激啊!!!!谢谢!!!!!
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junjieshao

禁虫 (小有名气)

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9楼2020-10-03 00:43:47
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syn1985

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
有条带回收后又消失了那就表明你的浓度不够 一次多做几管20ul体系的就可以了 如果pET-32a空载体双酶切下的片段很小建议直接用产物回收盒回收 跑一次琼脂糖还是很浪费的
2楼2012-06-30 15:20:15
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yuzhiming

捐助贵宾 (知名作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我在怀疑你的pET-32a菌株有问题。
你提取的可能不是质粒,是基因组。
3楼2012-07-01 11:32:03
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675250244

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
两种情况:
一、可能在酶切过程中存在污染,第一你用的灭菌水有没有问题?第二在37度酶切时你用封口膜把EP管的口封实了么?因为在这个温度下酶切水浴锅里的水可能会进去,会把质粒降解掉。
二、在酶切后跑电泳有其他杂带么?如果有的 话可能你加的酶的量太多了,这两个酶的特异性如果不太好的 话,在酶量过多的情况下就会把质粒切成小片段,而目的基因不会的原因是质粒是圆形的,比目的基因更好切,
坚持每一天
4楼2012-07-01 12:22:17
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