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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 鱼肠道微生物DNA的提取方法
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luocongqiang

铁虫 (小有名气)

[求助] 鱼肠道微生物DNA的提取方法

有人做个鱼肠道微生物菌群研究的吗，我用omega的粪便试剂盒提取效果总是不好。想请问下有没有别的效果好点的试剂盒啊，谢谢
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1楼 2012-06-28 12:25:30
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

李晓宏东华

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
以鲫肠道内容物为样本,用PBS多次洗涤,离心样品,沉淀菌体。使用试剂盒法提取肠道菌群总DNA,电泳结果显示,样品DNA条带明亮,无降解现象,可用于后续分子生物学试验研究;通过设计的细菌通用引物,对其16S rDNA基因进行PCR扩增,得到较清晰的图谱,条带整齐;表明采用该方法提取鱼类肠道微生物群落的DNA较为简单、准确、可行。
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5楼2012-06-28 21:33:08
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普通回帖

quiller2000

木虫 (著名写手)
后面是做测序的吗？
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致良知
2楼2012-06-28 13:17:31
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luocongqiang

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by quiller2000 at 2012-06-28 13:17:31
后面是做测序的吗？

恩恩 是要测序的 你也做吗
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3楼2012-06-28 17:43:47
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371522029

金虫 (正式写手)

小鱼儿

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你是要研究它们的群落结构。也就是说说有种群的基因必须全部按原来比例提取吗？
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4楼2012-06-28 18:56:30
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quiller2000

木虫 (著名写手)
水生所的？
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致良知
6楼2012-06-28 21:49:57
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xiadongliang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用自己配置的CTAB/SDS 法提取就可以，问题应该也不大。
鱼内容物样品应该还是比较好处理的吧。
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7楼2012-06-29 08:57:50
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lei5198

金虫 (初入文坛)

lei5198

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以尝试先将肠道里的菌在无菌环境下洗下来，然后涂板，扩培后在提取DNA。这样可能会容易些！
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凡事都怕认真
8楼2012-06-30 09:34:21
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luocongqiang

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiadongliang at 2012-06-29 08:57:50
用自己配置的CTAB/SDS 法提取就可以，问题应该也不大。
鱼内容物样品应该还是比较好处理的吧。

哦 没试过手提的 用过试剂盒感觉不是很好 准备用手提的试试 谢谢指点
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9楼2012-07-01 21:54:05
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luocongqiang

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by lei5198 at 2012-06-30 09:34:21
可以尝试先将肠道里的菌在无菌环境下洗下来，然后涂板，扩培后在提取DNA。这样可能会容易些！

恩恩 应该也可以 可能就是一些厌氧的提不出来
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10楼2012-07-01 21:54:47
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