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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » PYMOL与VMD作图的区别
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qingxueer

金虫 (初入文坛)

[求助] PYMOL与VMD作图的区别 已有2人参与

请哪位同学告诉我一下PYMOL与 VMD蛋白的三维图有什么区别吗？
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1楼 2012-06-27 22:00:02
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

caixin5120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 菜兄说的在理~ 2012-06-28 09:23:39
VMD除了pymol能实现的作图功能外还可以观看和计算动力学得到的结果。
pymol当然也有其优势，简单易学。其插件可以进分子对接，电荷，电子云分布等计算。

各有其优点，但总体上说，VMD更强悍。
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4楼2012-06-28 09:08:03
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see_uok

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

个人感觉pymol图形显示能力更好很多文章都用它来做图，VMD的Movie功能更强大
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7楼2012-09-11 09:39:48
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普通回帖

wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
一直都在用pymol感觉还不错，没用过vmd
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从小到大就没清闲过，要不就是穷，穷的活着没意思，要不就是累，累得活着没意思，现在是又穷又累了
2楼2012-06-28 00:07:19
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-28 09:08:27
这些都是可以实现三维图形显示的软件，好看与否与你的设置有关，从原理上来说，都可以画出蛋白的三维结构，蛋白与小分子的结合构象等等，这些都是共同的~
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3楼2012-06-28 08:06:24
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qingxueer

金虫 (初入文坛)
哦  谢谢大家啊
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5楼2012-06-28 21:07:05
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)
初学者用pymol，用的熟悉了之后用VMD！！
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6楼2012-06-29 10:17:04
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凌风阁少阁主

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by autodockytu at 2012-06-29 10:17:04
初学者用pymol，用的熟悉了之后用VMD！！

有VMD作图的教程吗，求
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琴声潇潇，落雨飘飘，滚滚红尘尽烟硝。
8楼2014-12-26 20:21:15
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声梦奇缘001

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 凌风阁少阁主 at 2014-12-26 20:21:15
有VMD作图的教程吗，求...

这里面有教程，你可以看看http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/
赞一下 回复此楼
只做不说，明知没地位，坚信有机会
9楼2014-12-27 07:49:00
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awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

简单一句，pymol做出来的漂亮。。完毕
赞一下 回复此楼
10楼2014-12-27 13:53:57
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