24小时热门版块排行榜    

查看: 5727  |  回复: 11

qingxueer

金虫 (初入文坛)

[求助] PYMOL与VMD作图的区别 已有2人参与

请哪位同学告诉我一下PYMOL与 VMD蛋白的三维图有什么区别吗?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 菜兄说的在理~ 2012-06-28 09:23:39
VMD除了pymol能实现的作图功能外还可以观看和计算动力学得到的结果。
pymol当然也有其优势,简单易学。其插件可以进分子对接,电荷,电子云分布等计算。

各有其优点,但总体上说,VMD更强悍。
4楼2012-06-28 09:08:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

see_uok

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

个人感觉pymol图形显示能力更好很多文章都用它来做图,VMD的Movie功能更强大
7楼2012-09-11 09:39:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一直都在用pymol感觉还不错,没用过vmd
从小到大就没清闲过,要不就是穷,穷的活着没意思,要不就是累,累得活着没意思,现在是又穷又累了
2楼2012-06-28 00:07:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-28 09:08:27
这些都是可以实现三维图形显示的软件,好看与否与你的设置有关,从原理上来说,都可以画出蛋白的三维结构,蛋白与小分子的结合构象等等,这些都是共同的~
3楼2012-06-28 08:06:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qingxueer

金虫 (初入文坛)

哦  谢谢大家啊
5楼2012-06-28 21:07:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


初学者用pymol,用的熟悉了之后用VMD!!
6楼2012-06-29 10:17:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凌风阁少阁主

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by autodockytu at 2012-06-29 10:17:04
初学者用pymol,用的熟悉了之后用VMD!!

有VMD作图的教程吗,求
琴声潇潇,落雨飘飘,滚滚红尘尽烟硝。
8楼2014-12-26 20:21:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

声梦奇缘001

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 凌风阁少阁主 at 2014-12-26 20:21:15
有VMD作图的教程吗,求...

这里面有教程,你可以看看http://www.ks.uiuc.edu/Training/Tutorials/
只做不说,明知没地位,坚信有机会
9楼2014-12-27 07:49:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

awaken2013

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

简单一句,pymol做出来的漂亮。。完毕
10楼2014-12-27 13:53:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qingxueer 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 5/250 2026-08-29 05:13 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +13 晴天加油 2026-08-26 14/700 2026-08-28 18:36 by huagongfeihu
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +3 德尚中行 2026-08-27 3/150 2026-08-28 15:24 by rongshuxia
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +5 zhaosm1982 2026-08-27 6/300 2026-08-27 16:00 by lfy8008
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
请填处理意见