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qingxueer

金虫 (初入文坛)

[求助] PYMOL与VMD作图的区别 已有2人参与

请哪位同学告诉我一下PYMOL与 VMD蛋白的三维图有什么区别吗?
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-06-28 09:08:27
这些都是可以实现三维图形显示的软件,好看与否与你的设置有关,从原理上来说,都可以画出蛋白的三维结构,蛋白与小分子的结合构象等等,这些都是共同的~
3楼2012-06-28 08:06:24
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wohaihao

荣誉版主 (著名写手)

保密局的……

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
一直都在用pymol感觉还不错,没用过vmd
从小到大就没清闲过,要不就是穷,穷的活着没意思,要不就是累,累得活着没意思,现在是又穷又累了
2楼2012-06-28 00:07:19
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caixin5120

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+3, 菜兄说的在理~ 2012-06-28 09:23:39
VMD除了pymol能实现的作图功能外还可以观看和计算动力学得到的结果。
pymol当然也有其优势,简单易学。其插件可以进分子对接,电荷,电子云分布等计算。

各有其优点,但总体上说,VMD更强悍。
4楼2012-06-28 09:08:03
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autodockytu

捐助贵宾 (小有名气)


初学者用pymol,用的熟悉了之后用VMD!!
6楼2012-06-29 10:17:04
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